More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5588 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  95.26 
 
 
359 aa  700  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  93 
 
 
359 aa  653  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  99.16 
 
 
359 aa  720  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  94.71 
 
 
359 aa  697  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  99.16 
 
 
359 aa  720  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  100 
 
 
359 aa  724  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  94.71 
 
 
359 aa  697  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  3.61687e-05 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0322  putative outer membrane porin  71.7 
 
 
383 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0969  putative outer membrane porin  71.7 
 
 
397 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0598  putative outer membrane porin  71.7 
 
 
383 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00212421  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1231  outer membrane porin  71.7 
 
 
432 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2491  outer membrane porin protein  71.7 
 
 
362 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1339  putative outer membrane porin OpcP  71.7 
 
 
362 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  72.75 
 
 
496 aa  516  1e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1303  outer membrane porin  72.89 
 
 
362 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  68.44 
 
 
357 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7056  porin Gram-negative type  68.16 
 
 
357 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.38539 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0172  OmpC family outer membrane porin  68.16 
 
 
357 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  52.31 
 
 
357 aa  356  4e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0260  outer membrane protein (porin)  45.35 
 
 
373 aa  285  6e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4632  porin Gram-negative type  43.39 
 
 
368 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.656997 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4631  porin Gram-negative type  39.78 
 
 
366 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0562233  normal  0.0152866 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4499  porin Gram-negative type  39.78 
 
 
366 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0190258  normal  0.402207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2717  OmpC family outer membrane porin  38.44 
 
 
355 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  4.57721e-05  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2803  OmpC family outer membrane porin  38.84 
 
 
360 aa  214  2e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011499  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4894  porin  35.16 
 
 
361 aa  202  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  38.25 
 
 
380 aa  198  1e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  37.81 
 
 
378 aa  197  2e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  38.25 
 
 
380 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  37.98 
 
 
380 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6034  porin  35.89 
 
 
382 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  37.98 
 
 
380 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  35.94 
 
 
380 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  38.08 
 
 
379 aa  190  3e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  41.67 
 
 
395 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1016  outer membrane porin  36.99 
 
 
358 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  36.2 
 
 
380 aa  189  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  41.48 
 
 
395 aa  184  2e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  41.76 
 
 
395 aa  184  2e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  42.31 
 
 
394 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  36.27 
 
 
392 aa  182  8e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0587  putative outer membrane porin  35.22 
 
 
365 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2322  outer membrane porin protein  35.22 
 
 
365 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1848  putative outer membrane porin  35.22 
 
 
365 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0156948  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0881  putative outer membrane porin  35.22 
 
 
365 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1102  outer membrane porin  35.89 
 
 
358 aa  180  3e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  34.77 
 
 
367 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  35.2 
 
 
390 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  35.34 
 
 
383 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  36.05 
 
 
369 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  34.16 
 
 
387 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  35.34 
 
 
383 aa  176  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  40.48 
 
 
398 aa  175  1e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  37.02 
 
 
409 aa  174  2e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  36.44 
 
 
383 aa  174  2e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  40.48 
 
 
398 aa  174  2e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  36.12 
 
 
379 aa  174  3e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  34.79 
 
 
391 aa  174  3e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  34.15 
 
 
411 aa  173  4e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  35.98 
 
 
396 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  36.5 
 
 
384 aa  172  6e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  37.46 
 
 
362 aa  172  8e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  37.46 
 
 
362 aa  172  8e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  37.46 
 
 
362 aa  172  8e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2000  porin Gram-negative type  34.92 
 
 
404 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  34.6 
 
 
384 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  35.57 
 
 
383 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  34.73 
 
 
384 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  34.27 
 
 
381 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2524  OmpC family outer membrane porin  37.04 
 
 
362 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510501  normal  0.104939 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  35.28 
 
 
386 aa  169  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  35.23 
 
 
379 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  36.59 
 
 
385 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  33.51 
 
 
380 aa  169  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  35.38 
 
 
383 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  35.82 
 
 
394 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  35.5 
 
 
375 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  34.46 
 
 
384 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  35.23 
 
 
375 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  34.46 
 
 
384 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  34.77 
 
 
384 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  34.35 
 
 
383 aa  167  3e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  35.77 
 
 
375 aa  167  3e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  35.77 
 
 
375 aa  167  3e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  34.2 
 
 
384 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  34.2 
 
 
384 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  34.2 
 
 
384 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  34.43 
 
 
391 aa  166  6e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  33.85 
 
 
381 aa  166  7e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  33.85 
 
 
381 aa  166  7e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  34.18 
 
 
383 aa  166  7e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  35.32 
 
 
394 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  37.33 
 
 
361 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  34.34 
 
 
386 aa  165  1e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6404  porin Gram-negative type  32.38 
 
 
359 aa  165  1e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  34.2 
 
 
384 aa  165  1e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  35.03 
 
 
394 aa  164  2e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  36.19 
 
 
374 aa  164  2e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  33.93 
 
 
379 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  3.37977e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  32.9 
 
 
383 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>