84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5381 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5381  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  400  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782244  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4905  hypothetical protein  97.42 
 
 
194 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.556359  normal  0.961888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3461  hypothetical protein  97.42 
 
 
194 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4337  hypothetical protein  88.77 
 
 
192 aa  346  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0844376  hitchhiker  0.00670192 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4854  hypothetical protein  85.49 
 
 
192 aa  342  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388946  normal  0.0401842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0793  hypothetical protein  87.5 
 
 
198 aa  340  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4926  hypothetical protein  81.68 
 
 
191 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3237  hypothetical protein  81.68 
 
 
191 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  76.97 
 
 
185 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3855  hypothetical protein  66.29 
 
 
178 aa  257  9e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.588539  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1577  hypothetical protein  65.9 
 
 
180 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  61.71 
 
 
182 aa  230  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4609  hypothetical protein  56.57 
 
 
177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155084  normal  0.570285 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3526  hypothetical protein  57.14 
 
 
177 aa  215  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4695  protein of unknown function DUF1130  58.29 
 
 
180 aa  204  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0878626  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1153  protein of unknown function DUF1130  48.94 
 
 
195 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.908122 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0033  protein of unknown function DUF1130  52.91 
 
 
183 aa  174  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0015  hypothetical protein  52.33 
 
 
183 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  46.6 
 
 
190 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  46.55 
 
 
178 aa  149  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  45.09 
 
 
191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3417  hypothetical protein  42.61 
 
 
171 aa  141  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3471  hypothetical protein  45.35 
 
 
197 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.646682  normal  0.0531544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  43.71 
 
 
186 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4534  protein of unknown function DUF1130  43.68 
 
 
181 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360408  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  44.97 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3408  hypothetical protein  45.86 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  42.35 
 
 
177 aa  128  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3555  protein of unknown function DUF1130  45.91 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3491  protein of unknown function DUF1130  47.17 
 
 
176 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4255  hypothetical protein  36.72 
 
 
178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4341  hypothetical protein  36.72 
 
 
178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.127657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4634  hypothetical protein  36.72 
 
 
178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4520  hypothetical protein  36.78 
 
 
176 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1426  protein of unknown function DUF1130  34.57 
 
 
184 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000439309  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0017  hypothetical protein  36.84 
 
 
177 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30650  hypothetical protein  34.83 
 
 
196 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1437  hypothetical protein  35.6 
 
 
224 aa  102  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0796  protein of unknown function DUF1130  36 
 
 
176 aa  100  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30420  hypothetical protein  31.4 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.711369  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0956  hypothetical protein  37.5 
 
 
198 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.98733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2160  hypothetical protein  34.52 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3108  hypothetical protein  46.67 
 
 
106 aa  77  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0971254  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3801  hypothetical protein  34.44 
 
 
154 aa  77  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0457  hypothetical protein  32.9 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2774  hypothetical protein  35.03 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670042  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0317  hypothetical protein  40.21 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000191328  decreased coverage  0.00259322 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2844  protein of unknown function DUF1130  28.57 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000271396  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2541  hypothetical protein  29.41 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1081  hypothetical protein  30.34 
 
 
148 aa  60.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0626  protein of unknown function DUF1130  29.14 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  30.46 
 
 
160 aa  58.9  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0743  hypothetical protein  33.08 
 
 
319 aa  58.5  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0251  hypothetical protein  29.37 
 
 
148 aa  58.2  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1069  hypothetical protein  28.29 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000104806  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2268  hypothetical protein  32.28 
 
 
162 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.124459 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  30.15 
 
 
154 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3308  protein of unknown function DUF1130  45.9 
 
 
68 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  0.526797 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1162  hypothetical protein  30.3 
 
 
284 aa  55.1  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1257  hypothetical protein  26.97 
 
 
204 aa  55.1  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000444267  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2775  hypothetical protein  27.56 
 
 
159 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0654  protein of unknown function DUF1130  29.1 
 
 
208 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  29.03 
 
 
153 aa  52  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4240  hypothetical protein  27.86 
 
 
151 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0072533  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  26.14 
 
 
154 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3912  hypothetical protein  27.7 
 
 
151 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  25.17 
 
 
167 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4371  protein of unknown function DUF1130  29.73 
 
 
150 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.201417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2617  protein of unknown function DUF1130  27.27 
 
 
146 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.727406  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6081  protein of unknown function DUF1130  28 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1460  hypothetical protein  28.76 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0130  hypothetical protein  28.77 
 
 
143 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548194  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0781  hypothetical protein  30 
 
 
153 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.588126  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0773  protein of unknown function DUF1130  25.78 
 
 
294 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0304  hypothetical protein  29.77 
 
 
297 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  normal  0.186853 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4268  protein of unknown function DUF1130  30.2 
 
 
150 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3900  hypothetical protein  30.2 
 
 
150 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal  0.203782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1798  hypothetical protein  27.34 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000938448  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1109  hypothetical protein  26.03 
 
 
298 aa  44.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.137011  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5361  hypothetical protein  29.33 
 
 
147 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  25.53 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5517  hypothetical protein  26.62 
 
 
147 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4723  protein of unknown function DUF1130  29.29 
 
 
157 aa  41.6  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264076  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4463  hypothetical protein  27.5 
 
 
153 aa  41.6  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333038  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>