111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5361 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  93.65 
 
 		 189 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  94.18 
 
 		 189 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  88.2 
 
 		 161 aa  287  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  86.49 
 
 		 148 aa  263  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  85.81 
 
 		 148 aa  261  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 179 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  47.62 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  47 
 
 		 202 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 167 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 143 aa  92.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  45.05 
 
 		 172 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  44.04 
 
 		 147 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 163 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  46.94 
 
 		 158 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 151 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  39.26 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  34.97 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  39.81 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 120 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  42.17 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  31.06 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 157 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 136 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 150 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8638  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 159 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.280895  normal  0.673509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 165 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 150 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  32.58 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 138 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  24.31 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  26.27 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  26.28 
 
 		 175 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 153 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 164 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 150 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 155 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0548  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 143 aa  45.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  20.42 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 142 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 142 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4414  transcriptional regulator, MarR family  27.38 
 
 		 140 aa  44.7  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.552703 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 138 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 151 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 161 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 303 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3341  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 157 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  29.41 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0733  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 172 aa  42.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 322 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 334 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 156 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26770  transcriptional regulator  30.12 
 
 		 143 aa  42.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 156 aa  42  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  21.1 
 
 		 145 aa  42  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 145 aa  42  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>