107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5355 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0822  hypothetical protein  81.66 
 
 
675 aa  1123    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0538951  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2198  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  81.33 
 
 
770 aa  1193    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000221198  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0759  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  97.3 
 
 
740 aa  1465    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043283  decreased coverage  0.0000165021 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1771  amylo-alpha-1,6-glucosidase family  81.82 
 
 
758 aa  1183    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0110772  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0486  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  51.3 
 
 
711 aa  660    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49575  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  70.66 
 
 
757 aa  1035    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3435  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  99.73 
 
 
740 aa  1494    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000283292  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4363  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  93.93 
 
 
741 aa  1407    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718041  hitchhiker  0.000723282 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4932  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  99.73 
 
 
740 aa  1494    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0018634  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0038  amylo-alpha-1,6-glucosidase  81.33 
 
 
776 aa  1194    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000580185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0945  amylo-alpha-1,6-glucosidase  81.28 
 
 
770 aa  1189    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00012577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0852  amylo-alpha-1,6-glucosidase  81.33 
 
 
797 aa  1193    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200365  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1583  amylo-alpha-1,6-glucosidase  81.33 
 
 
776 aa  1194    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000129612  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3686  Amylo-alpha-16-glucosidase  91.62 
 
 
740 aa  1350    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844906  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  53.81 
 
 
720 aa  701    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5355  Amylo-alpha-16-glucosidase  100 
 
 
740 aa  1499    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000277082  decreased coverage  0.00794917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4880  Amylo-alpha-16-glucosidase  93.66 
 
 
740 aa  1402    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0220077  hitchhiker  0.0000000000344612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  70.27 
 
 
759 aa  1022    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  70.66 
 
 
757 aa  1031    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17280  amylo-alpha-1,6-glucosidase  55.24 
 
 
717 aa  707    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0703  Amylo-alpha-16-glucosidase  55.71 
 
 
716 aa  719    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  45.58 
 
 
732 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1034  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  46 
 
 
731 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2783  hypothetical protein  45.44 
 
 
733 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0758936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3211  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  44.03 
 
 
732 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0418  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  44.8 
 
 
735 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0328  amylo-alpha-1,6-glucosidase  44.91 
 
 
733 aa  566  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2111  amylo-alpha-1,6-glucosidase  46.14 
 
 
741 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.24 
 
 
732 aa  558  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  42.37 
 
 
723 aa  553  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.97 
 
 
734 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0692  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.88 
 
 
734 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418529  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.29 
 
 
729 aa  548  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  43.48 
 
 
734 aa  544  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2711  Amylo-alpha-16-glucosidase  47.22 
 
 
733 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5196  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.1 
 
 
736 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350513  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.74 
 
 
764 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.18 
 
 
781 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1907  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.66 
 
 
778 aa  519  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.801386  normal  0.417986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  43.18 
 
 
765 aa  522  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1625  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.79 
 
 
778 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1611  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.97 
 
 
778 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499366 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  44.08 
 
 
736 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2320  Amylo-alpha-16-glucosidase  41.55 
 
 
729 aa  511  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0240963 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.66 
 
 
735 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  40.32 
 
 
751 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2802  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.24 
 
 
751 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0523697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2895  Amylo-alpha-16-glucosidase  42.24 
 
 
751 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2709  hypothetical protein  40.86 
 
 
751 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.06 
 
 
698 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  38.45 
 
 
708 aa  437  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1533  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  40.4 
 
 
721 aa  435  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.075154  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  38.47 
 
 
720 aa  422  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.87 
 
 
725 aa  425  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3611  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.71 
 
 
723 aa  413  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2675  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.57 
 
 
741 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4724  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.99 
 
 
760 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2846  amylo-alpha-16-glucosidase  35.06 
 
 
758 aa  404  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.876623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0912  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.39 
 
 
746 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.76 
 
 
724 aa  395  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4489  Amylo-alpha-16-glucosidase  36.92 
 
 
741 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  32.96 
 
 
727 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.32 
 
 
719 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2789  Amylo-alpha-16-glucosidase  37.26 
 
 
612 aa  357  3.9999999999999996e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.878962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1962  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.79 
 
 
722 aa  354  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.857705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2979  hypothetical protein  34.11 
 
 
712 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0633  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.05 
 
 
623 aa  342  1e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.813829 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  34.58 
 
 
729 aa  341  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  36.99 
 
 
700 aa  336  9e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20180  glycogen debranching enzyme  34.88 
 
 
715 aa  336  9e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0209994  normal  0.0622717 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.89 
 
 
733 aa  332  2e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3563  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.2 
 
 
685 aa  331  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  34.74 
 
 
737 aa  332  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  35.41 
 
 
685 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  34.29 
 
 
723 aa  330  7e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0360  amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.51 
 
 
734 aa  327  5e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.04 
 
 
726 aa  317  4e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1771  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.66 
 
 
718 aa  315  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000954501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  35.07 
 
 
706 aa  314  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0441  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  37.56 
 
 
658 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0748  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.9 
 
 
628 aa  297  6e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.188774  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1671  amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.03 
 
 
691 aa  279  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.28992  normal  0.813696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1677  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  34.03 
 
 
691 aa  275  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  34.86 
 
 
682 aa  259  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0814  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  29.22 
 
 
776 aa  258  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0704029  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6734  Amylo-alpha-16-glucosidase  33 
 
 
708 aa  257  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3955  hypothetical protein  34.18 
 
 
716 aa  256  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148683  normal  0.0140585 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06360  glycogen debranching enzyme  32.57 
 
 
645 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1957  Amylo-alpha-16-glucosidase  33.77 
 
 
689 aa  229  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705949  decreased coverage  0.0000163059 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3761  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  35.68 
 
 
654 aa  220  7.999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.19 
 
 
868 aa  92.8  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0376  glycogen debranching protein  25.79 
 
 
834 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  24.01 
 
 
810 aa  59.3  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  27.97 
 
 
610 aa  58.9  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  22.05 
 
 
712 aa  54.7  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  22.25 
 
 
732 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.55 
 
 
565 aa  53.5  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  24.55 
 
 
678 aa  51.6  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  19.95 
 
 
852 aa  51.2  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  22.19 
 
 
581 aa  50.8  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>