158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5354 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  41.66 
 
 		 3506 aa  744    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  84.72 
 
 		 2396 aa  3294    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 2365 aa  4214    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  64.1 
 
 		 1508 aa  1229    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  49.46 
 
 		 3822 aa  1023    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  48.71 
 
 		 3954 aa  1077    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  86.35 
 
 		 2371 aa  3156    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  99.62 
 
 		 2346 aa  3816    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  49.42 
 
 		 4238 aa  1024    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  86.09 
 
 		 2366 aa  3316    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  47.55 
 
 		 3629 aa  826    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  49.39 
 
 		 4238 aa  1016    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  31.24 
 
 		 1881 aa  496  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  37.95 
 
 		 2711 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  36.53 
 
 		 1119 aa  456  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.28 
 
 		 1227 aa  446  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.74 
 
 		 1848 aa  429  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  40.2 
 
 		 1971 aa  422  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  32.1 
 
 		 2003 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  41.18 
 
 		 986 aa  391  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  40.63 
 
 		 995 aa  390  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.06 
 
 		 1029 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.92 
 
 		 1285 aa  382  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  36.98 
 
 		 650 aa  350  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  34.26 
 
 		 1519 aa  348  6e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  37.99 
 
 		 1033 aa  336  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  34.85 
 
 		 1782 aa  329  4.0000000000000003e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  37.14 
 
 		 1004 aa  327  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  33.09 
 
 		 1530 aa  317  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  36.1 
 
 		 2906 aa  310  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  33.95 
 
 		 990 aa  303  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  36.85 
 
 		 991 aa  299  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.02 
 
 		 919 aa  299  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  36.82 
 
 		 995 aa  298  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  38.89 
 
 		 1458 aa  295  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6534  outer membrane autotransporter barrel  52.13 
 
 		 415 aa  294  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0435676  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  36.82 
 
 		 1028 aa  292  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  36.5 
 
 		 983 aa  290  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  35.28 
 
 		 1055 aa  289  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  46.64 
 
 		 1459 aa  287  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  39.88 
 
 		 1053 aa  285  7.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  35.84 
 
 		 1001 aa  279  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  35.45 
 
 		 1038 aa  278  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  35.49 
 
 		 1001 aa  275  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  51.61 
 
 		 1550 aa  275  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  34.08 
 
 		 1164 aa  267  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.75 
 
 		 972 aa  266  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.31 
 
 		 1011 aa  263  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  38.34 
 
 		 1172 aa  257  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  36 
 
 		 985 aa  253  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  34.2 
 
 		 1333 aa  251  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  38.08 
 
 		 1056 aa  250  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  32.92 
 
 		 3322 aa  241  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  34.68 
 
 		 994 aa  238  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  33.58 
 
 		 1129 aa  228  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  33.58 
 
 		 1131 aa  228  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  33.43 
 
 		 1129 aa  226  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  33.43 
 
 		 1131 aa  226  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  33.43 
 
 		 1131 aa  226  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  33.43 
 
 		 1131 aa  226  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  35.11 
 
 		 980 aa  225  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  35.6 
 
 		 1130 aa  219  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  33.24 
 
 		 1131 aa  219  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  35.26 
 
 		 2578 aa  213  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  34.89 
 
 		 1062 aa  211  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  33.83 
 
 		 1016 aa  209  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  32.61 
 
 		 1152 aa  198  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  31.64 
 
 		 1006 aa  197  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  30.42 
 
 		 677 aa  194  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  32.85 
 
 		 3420 aa  192  7e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.95 
 
 		 1532 aa  192  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  30.49 
 
 		 1111 aa  189  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  32.63 
 
 		 3415 aa  187  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.77 
 
 		 1322 aa  184  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  31.77 
 
 		 1011 aa  180  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.74 
 
 		 1081 aa  171  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.76 
 
 		 1125 aa  163  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  39.77 
 
 		 2363 aa  155  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  36.92 
 
 		 1882 aa  152  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  40.34 
 
 		 1130 aa  152  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  44.48 
 
 		 1593 aa  148  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  28.42 
 
 		 2057 aa  140  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  36.68 
 
 		 1113 aa  140  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  32.98 
 
 		 1741 aa  140  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  32.98 
 
 		 407 aa  136  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  32.72 
 
 		 488 aa  136  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  34.09 
 
 		 2926 aa  133  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  30.7 
 
 		 882 aa  133  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  30.52 
 
 		 816 aa  132  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  29.24 
 
 		 1180 aa  130  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  33.98 
 
 		 3391 aa  130  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  34.94 
 
 		 2642 aa  127  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.4 
 
 		 1694 aa  125  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0082  beta strand repeat-containing protein  29.32 
 
 		 1300 aa  117  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  33.99 
 
 		 3089 aa  115  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  40.44 
 
 		 950 aa  111  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  34.27 
 
 		 861 aa  109  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  27.55 
 
 		 1769 aa  106  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  28.05 
 
 		 814 aa  105  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3372  autotransporter beta-domain-containing protein  27.42 
 
 		 311 aa  105  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>