215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5201 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  97.21 
 
 
323 aa  651  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  97.21 
 
 
323 aa  653  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  98.14 
 
 
323 aa  659  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  99.69 
 
 
323 aa  667  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  98.14 
 
 
323 aa  659  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  96.59 
 
 
323 aa  650  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  99.69 
 
 
323 aa  667  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  100 
 
 
323 aa  668  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  91.02 
 
 
323 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  91.02 
 
 
323 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  90.71 
 
 
323 aa  619  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  91.02 
 
 
323 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  90.71 
 
 
323 aa  617  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  90.71 
 
 
323 aa  617  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  91.02 
 
 
323 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  91.02 
 
 
323 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  90.4 
 
 
323 aa  616  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  84.74 
 
 
323 aa  576  1e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  83.8 
 
 
323 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  76.95 
 
 
323 aa  534  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  76.64 
 
 
323 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  71.96 
 
 
323 aa  498  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  69.78 
 
 
325 aa  484  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  69.78 
 
 
325 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  70.09 
 
 
325 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  70.09 
 
 
325 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  69.91 
 
 
320 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  70.09 
 
 
325 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  69.78 
 
 
325 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  70.09 
 
 
325 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  69.16 
 
 
325 aa  478  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  69.91 
 
 
328 aa  475  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  68.22 
 
 
325 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  68.01 
 
 
325 aa  470  1e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  66.04 
 
 
325 aa  459  1e-128  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  61.42 
 
 
324 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  57.45 
 
 
332 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  37.38 
 
 
323 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  34.46 
 
 
332 aa  222  5e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  34.47 
 
 
328 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  34.56 
 
 
328 aa  218  9e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  33.95 
 
 
329 aa  214  2e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  32 
 
 
329 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  34.57 
 
 
336 aa  206  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  31.69 
 
 
329 aa  206  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  32.12 
 
 
329 aa  201  2e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  35.48 
 
 
357 aa  196  5e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  31 
 
 
327 aa  193  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  30.56 
 
 
329 aa  192  5e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  35.28 
 
 
377 aa  189  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  30.22 
 
 
326 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  28.79 
 
 
346 aa  182  5e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1602  peptidase M19, renal dipeptidase  31.78 
 
 
323 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.184491  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  33.33 
 
 
368 aa  173  4e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  34.98 
 
 
332 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  32.12 
 
 
327 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  30.81 
 
 
386 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  30.43 
 
 
311 aa  148  1e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  28.98 
 
 
348 aa  147  2e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  28.78 
 
 
328 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.44928e-05  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  29.77 
 
 
402 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  33.79 
 
 
332 aa  142  7e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  31.03 
 
 
338 aa  142  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  30.43 
 
 
312 aa  141  2e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  30.26 
 
 
355 aa  140  4e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  33.2 
 
 
307 aa  139  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  31.85 
 
 
602 aa  138  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  29.43 
 
 
315 aa  133  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  27.84 
 
 
311 aa  131  2e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  28 
 
 
315 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.19053e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  25.85 
 
 
412 aa  130  4e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  27.16 
 
 
438 aa  128  1e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  29.89 
 
 
313 aa  126  4e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  26.35 
 
 
399 aa  126  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2434  Membrane dipeptidase  25.84 
 
 
381 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.911642  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  33.33 
 
 
350 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  28.16 
 
 
399 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  27.05 
 
 
333 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  25.71 
 
 
433 aa  122  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  4.16179e-06  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  27.22 
 
 
379 aa  122  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  26.98 
 
 
419 aa  122  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  25.67 
 
 
444 aa  120  2e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  28.3 
 
 
400 aa  120  4e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  26.26 
 
 
337 aa  120  4e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  26.4 
 
 
335 aa  120  4e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  29.5 
 
 
333 aa  119  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  25.51 
 
 
394 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  27.17 
 
 
326 aa  117  2e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  28.21 
 
 
320 aa  117  2e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  25.94 
 
 
329 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3959  Membrane dipeptidase  27.3 
 
 
412 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.651593  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6121  Membrane dipeptidase  28.42 
 
 
402 aa  115  1e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99517  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  25.55 
 
 
385 aa  115  1e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3883  membrane dipeptidase  29.81 
 
 
342 aa  114  2e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  28.39 
 
 
297 aa  114  2e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  24.84 
 
 
388 aa  114  2e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2579  membrane dipeptidase  25 
 
 
429 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6819  Membrane dipeptidase  23.26 
 
 
345 aa  113  4e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714223  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  35.42 
 
 
307 aa  112  7e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  27.72 
 
 
355 aa  112  7e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>