37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5197 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5197  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  363  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5199  hypothetical protein  51.16 
 
 
90 aa  84.3  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296541  normal  0.38964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1929  hypothetical protein  48.84 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  31.18 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2604  hypothetical protein  36 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.15466 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2633  hypothetical protein  33.87 
 
 
184 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  31.18 
 
 
175 aa  62  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2607  hypothetical protein  30.94 
 
 
178 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1358  hypothetical protein  30.64 
 
 
177 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  28.9 
 
 
173 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  30.06 
 
 
178 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0266  hypothetical protein  40.66 
 
 
203 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  28.57 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0051  hypothetical protein  28.25 
 
 
178 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0341142  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3309  hypothetical protein  25.41 
 
 
191 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5468  GP29  42.65 
 
 
81 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5089  hypothetical protein  39.02 
 
 
152 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  38.03 
 
 
87 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5365  GP29  39.71 
 
 
89 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03514  paar motif family  34.91 
 
 
133 aa  45.1  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2083  hypothetical protein  38.46 
 
 
466 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  36.08 
 
 
135 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3641  GP29  36.62 
 
 
83 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  36.26 
 
 
137 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5071  PAAR repeat-containing protein  46 
 
 
136 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  43.28 
 
 
453 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  37.5 
 
 
102 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0734  GP29  34.33 
 
 
86 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3384  hypothetical protein  28.57 
 
 
193 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2741  hypothetical protein  37.84 
 
 
89 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111106  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1974  hypothetical protein  27.33 
 
 
193 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342868  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1060  hypothetical protein  37.18 
 
 
193 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158386  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0646  hypothetical protein  37.18 
 
 
466 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  32.58 
 
 
94 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0524925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0797  PAAR domain-containing protein  41.18 
 
 
352 aa  41.2  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  36.84 
 
 
135 aa  40.8  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  36.59 
 
 
88 aa  40.8  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>