More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5194 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  100 
 
 
478 aa  969    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  78.78 
 
 
479 aa  754    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5025  transcriptional regulator  84.45 
 
 
472 aa  762    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  85.56 
 
 
473 aa  825    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  98.33 
 
 
478 aa  953    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4500  GntR family transcriptional regulator  84.45 
 
 
472 aa  763    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.705718  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  98.33 
 
 
478 aa  953    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  55.74 
 
 
483 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.81 
 
 
483 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  54.03 
 
 
487 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  54.35 
 
 
471 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  54.35 
 
 
500 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52.13 
 
 
471 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  54.43 
 
 
477 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  54.43 
 
 
477 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  54.12 
 
 
477 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  54.43 
 
 
477 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  54.74 
 
 
483 aa  491  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  54.43 
 
 
477 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  53.4 
 
 
469 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  53.91 
 
 
477 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  52.55 
 
 
471 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  52.43 
 
 
473 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  52.11 
 
 
491 aa  478  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  53.6 
 
 
469 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  53.68 
 
 
469 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  53.89 
 
 
469 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5785  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  53.68 
 
 
483 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3050  GntR family transcriptional regulator  52.27 
 
 
491 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1569  GntR family transcriptional regulator  52.07 
 
 
491 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1468  GntR family transcriptional regulator  52.27 
 
 
493 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0527  GntR family transcriptional regulator  52.27 
 
 
493 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0626  GntR family transcriptional regulator  52.27 
 
 
493 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1243  GntR family transcriptional regulator  52.27 
 
 
493 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.396682  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1437  GntR family transcriptional regulator  51.75 
 
 
494 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  50.11 
 
 
477 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6902  transcriptional regulator  52.63 
 
 
488 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78999  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  50.63 
 
 
470 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.79 
 
 
470 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  50.42 
 
 
472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  50.11 
 
 
481 aa  448  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  49.89 
 
 
482 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.05 
 
 
484 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  48.95 
 
 
470 aa  430  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  48.64 
 
 
473 aa  431  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  50.53 
 
 
476 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  46.37 
 
 
489 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  47.23 
 
 
472 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  47.88 
 
 
481 aa  398  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  44.04 
 
 
473 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0367  GntR family transcriptional regulator  42.02 
 
 
473 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.28 
 
 
473 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  43.79 
 
 
475 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  43.93 
 
 
473 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  43.58 
 
 
473 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  48.01 
 
 
482 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  42.95 
 
 
473 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.98 
 
 
483 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  44 
 
 
478 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  42.13 
 
 
470 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.13 
 
 
470 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  43.1 
 
 
473 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  41.49 
 
 
468 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  44.33 
 
 
532 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  42.71 
 
 
483 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
473 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.91 
 
 
472 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  41.91 
 
 
470 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  42.83 
 
 
478 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  41.49 
 
 
470 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
479 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.02 
 
 
475 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.38 
 
 
477 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  42.89 
 
 
478 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  41.7 
 
 
470 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  42.95 
 
 
474 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
483 aa  373  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  41.91 
 
 
477 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
472 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
472 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
472 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 
479 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  44.54 
 
 
493 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
472 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  39.79 
 
 
474 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
475 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
474 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
472 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
474 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
472 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  42.44 
 
 
474 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  42.32 
 
 
474 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  42.11 
 
 
474 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  39.79 
 
 
463 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  42.44 
 
 
474 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  42.11 
 
 
475 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2231  GntR family transcriptional regulator  44.99 
 
 
433 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  42.44 
 
 
474 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  42.74 
 
 
474 aa  369  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2521  aminotransferase  44.99 
 
 
433 aa  368  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>