50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5098 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  62.33 
 
 		 291 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  41.83 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  36.6 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  38.52 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  32.67 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  32.84 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  30.8 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  28.51 
 
 		 270 aa  89.7  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  31.79 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1566  hypothetical protein  79.55 
 
 		 130 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902821  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  26.03 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  34.33 
 
 		 188 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  26.15 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  33.87 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  27.54 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  28.93 
 
 		 170 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  30.2 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  27.54 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  31.48 
 
 		 399 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  30.51 
 
 		 266 aa  52.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  25.23 
 
 		 295 aa  52.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  31.46 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  27.94 
 
 		 182 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  27.78 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  23.36 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  26.92 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  29.06 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  29.06 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  31.96 
 
 		 177 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  38.81 
 
 		 425 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  30.3 
 
 		 401 aa  46.6  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  32.06 
 
 		 168 aa  46.2  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  27.34 
 
 		 175 aa  45.8  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  30.23 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  27.27 
 
 		 386 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  20.86 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  26.26 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  26.61 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  26.61 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  32.63 
 
 		 173 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  35.38 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  35.56 
 
 		 355 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  38.1 
 
 		 171 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  36.9 
 
 		 169 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  29.76 
 
 		 352 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  33.1 
 
 		 156 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  31.18 
 
 		 366 aa  42.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>