More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4966 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  100 
 
 
447 aa  894    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  85.45 
 
 
448 aa  709    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  85.45 
 
 
448 aa  709    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  85.45 
 
 
448 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  85.45 
 
 
448 aa  709    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  91.29 
 
 
444 aa  795    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  85.45 
 
 
448 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  94.67 
 
 
450 aa  841    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  94.88 
 
 
449 aa  855    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  85.51 
 
 
448 aa  733    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  79.56 
 
 
456 aa  714    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  85.45 
 
 
448 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  99.55 
 
 
447 aa  890    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  93.85 
 
 
455 aa  841    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  78.95 
 
 
458 aa  692    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  85.45 
 
 
448 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  99.55 
 
 
447 aa  890    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  59.95 
 
 
449 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  60.42 
 
 
449 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  47.57 
 
 
449 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  49.55 
 
 
467 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  50.46 
 
 
436 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  49.89 
 
 
436 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  47.73 
 
 
446 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  47.73 
 
 
446 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 
442 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  50.8 
 
 
478 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  46.97 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  45.64 
 
 
450 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  46.67 
 
 
453 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  46.67 
 
 
454 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  45.37 
 
 
450 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  46.44 
 
 
454 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  44.55 
 
 
451 aa  398  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  46.44 
 
 
454 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  44.72 
 
 
450 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  44.72 
 
 
450 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  44.3 
 
 
438 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  44.72 
 
 
450 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  44.72 
 
 
450 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  44.72 
 
 
450 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  44.72 
 
 
450 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  44.72 
 
 
450 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  44.94 
 
 
450 aa  398  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  44.85 
 
 
452 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  44.62 
 
 
440 aa  393  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  44.62 
 
 
452 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  44.62 
 
 
452 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  44.11 
 
 
428 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  44.62 
 
 
452 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  44.11 
 
 
428 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  44.62 
 
 
452 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  45.66 
 
 
463 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  48.94 
 
 
463 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  48.02 
 
 
429 aa  391  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  45.98 
 
 
461 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  45.98 
 
 
468 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  47.56 
 
 
461 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  48.7 
 
 
463 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  48.83 
 
 
469 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  43.88 
 
 
428 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  48.59 
 
 
464 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  48.7 
 
 
463 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  45.52 
 
 
461 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  45.12 
 
 
444 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0807  d-galactonate transporter  44.18 
 
 
450 aa  388  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  47.11 
 
 
479 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0841  d-galactonate transporter  44.27 
 
 
450 aa  388  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  44.5 
 
 
445 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  44.83 
 
 
444 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  47.13 
 
 
430 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  44.83 
 
 
444 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  44.83 
 
 
444 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  47.13 
 
 
430 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  47.13 
 
 
445 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  44.83 
 
 
444 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  44.83 
 
 
444 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  44.83 
 
 
444 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  44.83 
 
 
444 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  47.13 
 
 
430 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  47.13 
 
 
445 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  44.24 
 
 
438 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  46.9 
 
 
430 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  44.83 
 
 
444 aa  382  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  46.9 
 
 
430 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  43.87 
 
 
413 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  47.13 
 
 
430 aa  381  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  44.47 
 
 
450 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  44.24 
 
 
450 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  42.83 
 
 
485 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  43.71 
 
 
451 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  42.39 
 
 
485 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  46.71 
 
 
430 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  44.5 
 
 
458 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  46.21 
 
 
432 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  46.45 
 
 
432 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  46.45 
 
 
432 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  45.31 
 
 
450 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  44.02 
 
 
450 aa  372  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  45.18 
 
 
453 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>