235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4633 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4633  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 
101 aa  197  4e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  2.92632e-13  decreased coverage  2.43295e-05 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1570  H-NS histone family protein  70.1 
 
 
173 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  1.03893e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0079  H-NS histone family protein  70.1 
 
 
108 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  1.51227e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0098  H-NS histone family protein  70.1 
 
 
108 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  4.05362e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1506  H-NS histone family protein  70.1 
 
 
108 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  2.20305e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0068  H-NS histone family protein  70.1 
 
 
99 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  1.81219e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1225  H-NS histone family protein  70.1 
 
 
99 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  5.71024e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4282  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  68.04 
 
 
100 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0105949  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0265  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  66.33 
 
 
98 aa  125  2e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7383  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  64.36 
 
 
102 aa  120  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6191  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  64.65 
 
 
102 aa  119  1e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299615  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5922  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  64.65 
 
 
102 aa  119  2e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.997127  normal  0.678214 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6382  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  61.86 
 
 
99 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193522  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6084  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  61.86 
 
 
99 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78955  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6596  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  60.82 
 
 
96 aa  111  4e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540075  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6929  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  56.7 
 
 
99 aa  108  2e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.599841  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2135  putative DNA-binding protein  65.38 
 
 
79 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45202  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3806  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  55.79 
 
 
100 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0101066  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_003296  RS00711  putative HNS-like transcription regulator protein  61.62 
 
 
96 aa  102  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  1.72984e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0843  DNA-binding protein BprA  63.54 
 
 
96 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3721  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  60.61 
 
 
96 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00112888  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4798  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  60.61 
 
 
96 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272454  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5655  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  63.27 
 
 
128 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6922  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  57.14 
 
 
100 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2975  putative H-NS-like transcription regulator  52.08 
 
 
96 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1558  H-NS histone family protein  50 
 
 
131 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.752713  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5767  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.55 
 
 
99 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2072  H-NS histone family protein  61.46 
 
 
96 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0755  H-NS histone family protein  61.46 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0220992  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0569  HNS-like transcription regulator protein  61.46 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147609  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2075  DNA-binding protein BprA  61.46 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585602  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2160  DNA-binding protein BprA  61.46 
 
 
96 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1529  DNA-binding protein BprA  61.46 
 
 
96 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4285  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.96 
 
 
97 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02004  putative HNS-like transcription regulator protein  58.16 
 
 
95 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0969964  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3154  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  51.02 
 
 
100 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5214  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.02 
 
 
100 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.02 
 
 
100 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6696  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  58.76 
 
 
98 aa  94.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.685774  normal  0.68943 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0742  H-NS histone family protein  50.5 
 
 
104 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1174  H-NS histone family protein  50.5 
 
 
104 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1706  H-NS histone family protein  50.5 
 
 
104 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2442  H-NS histone family protein  50.5 
 
 
131 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1247  H-NS histone family protein  50.5 
 
 
96 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0720  H-NS histone family protein  50.5 
 
 
96 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232457  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0867  putative HNS-like transcription regulator protein  53.61 
 
 
96 aa  94  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0112  HNS-like transcriptional regulator  49.49 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  9.94611e-15  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3822  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.49 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000137841  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2714  DNA-binding protein BprA  50.5 
 
 
111 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344106  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.04 
 
 
99 aa  92.8  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  50 
 
 
91 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222409  normal  0.184824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.04 
 
 
96 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909068  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.83 
 
 
96 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.811955 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6035  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  56.7 
 
 
99 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.401704 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5671  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  56.7 
 
 
99 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6525  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  56.7 
 
 
99 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.381726 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3351  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  50.52 
 
 
98 aa  90.9  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.383074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0162  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.55 
 
 
98 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121985  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0175  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  51.55 
 
 
98 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3442  H-NS histone family protein  47.96 
 
 
98 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2965  H-NS histone family protein  48.45 
 
 
97 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3404  H-NS histone family protein  48.45 
 
 
97 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3943  H-NS histone family protein  47.96 
 
 
98 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0084  H-NS histone family protein  47.96 
 
 
98 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3862  H-NS histone family protein  47.96 
 
 
98 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1636  H-NS histone family protein  48.45 
 
 
97 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3827  H-NS histone family protein  48.45 
 
 
97 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0048  H-NS histone family protein  48.45 
 
 
125 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2867  H-NS histone family protein  47.96 
 
 
98 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3909  H-NS histone family protein  48.45 
 
 
97 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3109  H-NS histone family protein  47.96 
 
 
98 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1677  H-NS histone family protein  47.96 
 
 
98 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3155  H-NS histone family protein  48.45 
 
 
97 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2905  H-NS histone family protein  48.45 
 
 
97 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0099  H-NS histone family protein  46.94 
 
 
101 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0249  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.48 
 
 
98 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2858  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  49.48 
 
 
98 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.259744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0231  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  49.48 
 
 
98 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.45 
 
 
98 aa  86.3  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.45 
 
 
98 aa  86.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0126  H-NS histone family protein  45.92 
 
 
101 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5567  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  56.7 
 
 
99 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000568054  normal  0.0551965 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4689  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  57.83 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0208  H-NS histone family protein  45.92 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00707733  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1616  H-NS histone family protein  45.92 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7449  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  54.64 
 
 
99 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0263  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.42 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  48.45 
 
 
98 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2825  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  47.42 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0281  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  47.42 
 
 
97 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166699  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0116  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.9 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6005  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  46.23 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3189  H-NS histone family protein  45.92 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0195  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  46.39 
 
 
97 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750004  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0209  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  46.39 
 
 
97 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.726678 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3384  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  46.39 
 
 
97 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3224  DNA-binding protein BprA  43.88 
 
 
101 aa  82.8  1e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0088  DNA-binding protein BprA  43.88 
 
 
101 aa  82.8  1e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0190  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  46.39 
 
 
97 aa  82.4  2e-15  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317548  hitchhiker  1.90695e-08 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6777  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.9 
 
 
99 aa  82  3e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>