91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4432 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  100 
 
 
184 aa  380  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  100 
 
 
184 aa  380  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  97.28 
 
 
184 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  97.28 
 
 
184 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  97.28 
 
 
184 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  78.49 
 
 
186 aa  297  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  76.09 
 
 
184 aa  289  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  74.73 
 
 
186 aa  285  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  60.23 
 
 
182 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  60.23 
 
 
182 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  47.75 
 
 
187 aa  182  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  45.45 
 
 
190 aa  157  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  41.67 
 
 
206 aa  137  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  36.88 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  38.37 
 
 
189 aa  112  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  33.52 
 
 
179 aa  106  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  28.98 
 
 
181 aa  101  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  34.21 
 
 
202 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  34.07 
 
 
187 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  37.25 
 
 
180 aa  100  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  32.42 
 
 
186 aa  97.8  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  28.32 
 
 
181 aa  96.7  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  34.21 
 
 
199 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  36.43 
 
 
170 aa  94.7  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  39.67 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  32.03 
 
 
187 aa  92  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  43.33 
 
 
145 aa  90.1  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  34.57 
 
 
185 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  32.28 
 
 
189 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  35.59 
 
 
147 aa  87  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  34.97 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  34.44 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  37.33 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  28.57 
 
 
193 aa  79  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  37.29 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  33.77 
 
 
144 aa  77  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  40.43 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  33.88 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  32.64 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  36.59 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  28.79 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  28.66 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  36.7 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  40.62 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  38.05 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  25.95 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  28.33 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  29.45 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  33.33 
 
 
156 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  40.22 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  35.11 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  28.57 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  29.37 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  37.17 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  35.11 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  27.67 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  34.48 
 
 
179 aa  62.8  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  30.77 
 
 
200 aa  58.2  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  27.11 
 
 
187 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  26.51 
 
 
185 aa  55.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  36.71 
 
 
138 aa  53.9  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2054  OsmC family protein  35 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  28.07 
 
 
134 aa  48.9  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  30.12 
 
 
169 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1477  OsmC family protein  25.66 
 
 
137 aa  47.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  28.92 
 
 
168 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  26.09 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  26.09 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  28.92 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  27.17 
 
 
169 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  28.92 
 
 
169 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  29.59 
 
 
138 aa  46.2  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  26.6 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  24.47 
 
 
193 aa  45.1  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0218  hypothetical protein  34.25 
 
 
74 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  29.69 
 
 
357 aa  45.1  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  33.9 
 
 
188 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  32.2 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  32.2 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  32.2 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1957  OsmC family protein  28.36 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.226046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  27.35 
 
 
131 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  28.7 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  26.56 
 
 
410 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  26.09 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  25.49 
 
 
145 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  28.26 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  26.56 
 
 
410 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  24.07 
 
 
129 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0037  OsmC-like protein  35.06 
 
 
158 aa  42  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0206  OsmC family protein  31.63 
 
 
174 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.338673  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>