More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4394 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  97.98 
 
 		 209 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  97.98 
 
 		 209 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 214 aa  84.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0811  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.646976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  40.24 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  24.43 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  24.43 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  35.48 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  24.43 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  24.43 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  24.43 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  23.86 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  35.48 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  23.86 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  31.36 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  29.09 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2148  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  30.86 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 227 aa  52  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 214 aa  51.2  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  40.74 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>