More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4364 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
206 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  96.6 
 
 
206 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  96.6 
 
 
206 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  48.28 
 
 
206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
212 aa  178  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  47.29 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  47.29 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  47.29 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
205 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  47.78 
 
 
206 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  47.57 
 
 
206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  47.57 
 
 
206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  46.8 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  41.87 
 
 
205 aa  162  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  46.8 
 
 
206 aa  161  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  53.66 
 
 
225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  46.24 
 
 
187 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  49.62 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 
231 aa  95.5  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
208 aa  95.5  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
205 aa  91.7  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  52.56 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4804  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  39.32 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
214 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  30.46 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  58.46 
 
 
238 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  47.56 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  40.52 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 
241 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 
219 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  53.12 
 
 
326 aa  62  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
200 aa  61.6  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 
189 aa  61.6  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
234 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 
226 aa  60.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  32.14 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  44.94 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  44.83 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 
237 aa  59.7  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  45.78 
 
 
197 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
197 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  40.18 
 
 
195 aa  59.3  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
228 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  22.38 
 
 
228 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 
230 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
188 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 
196 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
249 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 
197 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 
205 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0686  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 
247 aa  57.8  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
182 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
198 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
221 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  46.51 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  45 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  44.05 
 
 
239 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 
210 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
215 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
202 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 
218 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 
197 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 
212 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
242 aa  55.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
203 aa  55.1  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
196 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3550  putative transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 
374 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0101342  normal 
 
 
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NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 
242 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
180 aa  55.1  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0206033 
 
 
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NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
208 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal 
 
 
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NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
195 aa  55.1  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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