More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4258 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  100 
 
 		 344 aa  689    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  72.38 
 
 		 344 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  76.09 
 
 		 344 aa  508  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  45.78 
 
 		 352 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  45.78 
 
 		 352 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  43.9 
 
 		 356 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  44.91 
 
 		 351 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  43.6 
 
 		 356 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  43.58 
 
 		 367 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  44.25 
 
 		 358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  39.01 
 
 		 361 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  43.95 
 
 		 358 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  43.62 
 
 		 358 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  43.84 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  43.84 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  44.05 
 
 		 358 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  39.78 
 
 		 359 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  43.41 
 
 		 361 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  44.18 
 
 		 358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  44.18 
 
 		 358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  44.18 
 
 		 358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  49.08 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  43.38 
 
 		 340 aa  232  9e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  42.51 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  41.32 
 
 		 358 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  40.48 
 
 		 387 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  40.48 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  40.48 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  39.03 
 
 		 363 aa  215  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  40.8 
 
 		 341 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  37.57 
 
 		 360 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  39.81 
 
 		 342 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  39.05 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  35.92 
 
 		 357 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  37.5 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  35.82 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  35.82 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  37.5 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  37.61 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  34.41 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  35.65 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  32.09 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  32.09 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  32.09 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  34.39 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  34.36 
 
 		 401 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  31.92 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  33.73 
 
 		 344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  31.08 
 
 		 386 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  32.52 
 
 		 355 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  29.01 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  31.53 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  31.91 
 
 		 339 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  29.72 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  31.7 
 
 		 376 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  34.3 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  32.15 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  32.15 
 
 		 354 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  31.09 
 
 		 394 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  33.33 
 
 		 353 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  31.53 
 
 		 355 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  32.2 
 
 		 393 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  30.39 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  31.45 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  32.77 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  30.43 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  29.8 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  32.42 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  29.8 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  31.62 
 
 		 375 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  30.7 
 
 		 388 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  29.94 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  29.94 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  40.59 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  40.59 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  31.42 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  31.3 
 
 		 357 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  30.56 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  30.79 
 
 		 386 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  32.14 
 
 		 374 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  30.79 
 
 		 386 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  32.14 
 
 		 383 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  31.04 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  31.04 
 
 		 394 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  31.9 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  31.04 
 
 		 394 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  30 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  31.12 
 
 		 350 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  30.82 
 
 		 366 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  30.1 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  29.69 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  30.52 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  29.06 
 
 		 523 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  31.01 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1323  outer membrane porin protein precursor  34.12 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  28.53 
 
 		 389 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  28.53 
 
 		 389 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  31.65 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3099  outer membrane porin  34.12 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  28.53 
 
 		 389 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>