More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4064 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  53.61 
 
 		 689 aa  757    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  48.22 
 
 		 756 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  54.23 
 
 		 704 aa  768    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  48.22 
 
 		 820 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  48.67 
 
 		 696 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  91.94 
 
 		 705 aa  1313    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  48.22 
 
 		 756 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  48.08 
 
 		 756 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  46.88 
 
 		 822 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  51.29 
 
 		 755 aa  657    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  48.22 
 
 		 756 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  48.22 
 
 		 756 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 707 aa  1440    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  48.22 
 
 		 756 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  50.88 
 
 		 712 aa  706    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  99.29 
 
 		 707 aa  1432    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  47.93 
 
 		 701 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  47.93 
 
 		 696 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  47.93 
 
 		 696 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  47.8 
 
 		 776 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  48.12 
 
 		 758 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  45.97 
 
 		 705 aa  616  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  45.52 
 
 		 738 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  44.4 
 
 		 747 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  46.37 
 
 		 747 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  44.4 
 
 		 747 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  46.07 
 
 		 770 aa  580  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  46.76 
 
 		 721 aa  580  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  42.88 
 
 		 708 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  42.46 
 
 		 720 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  42.54 
 
 		 718 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  43.36 
 
 		 727 aa  552  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  40.81 
 
 		 739 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  44.29 
 
 		 690 aa  545  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  40.54 
 
 		 742 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  41.78 
 
 		 708 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  40.4 
 
 		 728 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  41.63 
 
 		 746 aa  532  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  39.83 
 
 		 723 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  39.44 
 
 		 703 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  39.09 
 
 		 703 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  38.43 
 
 		 720 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  35.2 
 
 		 710 aa  360  6e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  33.57 
 
 		 716 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 		 749 aa  335  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  33.92 
 
 		 724 aa  333  5e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  35.39 
 
 		 730 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  34.71 
 
 		 730 aa  330  8e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 726 aa  327  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 		 717 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 735 aa  315  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 779 aa  312  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 		 717 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  32.01 
 
 		 784 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  30.54 
 
 		 728 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  31.27 
 
 		 813 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  30.92 
 
 		 797 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  31.07 
 
 		 721 aa  265  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  28.69 
 
 		 737 aa  251  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 		 399 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 770 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 710 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.76 
 
 		 601 aa  194  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 710 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 706 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 706 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 757 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 709 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 719 aa  179  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  27.16 
 
 		 695 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  29.79 
 
 		 527 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 730 aa  171  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  26.36 
 
 		 801 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 738 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 797 aa  161  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 792 aa  160  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  24.7 
 
 		 742 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 		 748 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  24.23 
 
 		 748 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 837 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  24.02 
 
 		 742 aa  157  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  26.5 
 
 		 831 aa  156  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 		 862 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 707 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  24.16 
 
 		 864 aa  156  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  24.19 
 
 		 740 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 817 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 860 aa  153  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  24.19 
 
 		 749 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 747 aa  152  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  24.66 
 
 		 850 aa  151  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  25.26 
 
 		 752 aa  150  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1142  TonB-dependent siderophore receptor  25.39 
 
 		 711 aa  150  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.634377  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  25.07 
 
 		 711 aa  150  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  24.49 
 
 		 729 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  25.48 
 
 		 689 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 		 700 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 701 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 		 745 aa  148  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 843 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>