More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4021 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4021  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 341 aa  704    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.655043  normal  0.26756 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  40.79 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  32.24 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.3 
 
 		 350 aa  122  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  30.45 
 
 		 302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  29 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  28.39 
 
 		 323 aa  112  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  26.99 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 344 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  28.9 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  26.73 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  28.99 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  28.71 
 
 		 311 aa  99.4  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  27.79 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  42.98 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  25.24 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  41.41 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  46.81 
 
 		 292 aa  90.1  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  39.86 
 
 		 287 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  39.29 
 
 		 283 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  42.15 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 		 288 aa  87  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  42.15 
 
 		 294 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  38.4 
 
 		 293 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  37.9 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.58 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  42.27 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  41.03 
 
 		 311 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  42.45 
 
 		 289 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  39.66 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  39.26 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  38.98 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  38.79 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  39.45 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  33.88 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  35.59 
 
 		 349 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  40.21 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 289 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  39.82 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  37.27 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  37.27 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  37.27 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  38.33 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  33.16 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  36.07 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  37.27 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  37.27 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  37.27 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  37.1 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05183  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14860)  31.11 
 
 		 780 aa  76.6  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  39.05 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 287 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  34.62 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  34.78 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  35.9 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  37.93 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  39.6 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  38.61 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3248  EphC  29.41 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  35.2 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 286 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>