45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3989 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2608  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  96.93 
 
 		 358 aa  694    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3989  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 		 358 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104406 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3530  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  99.72 
 
 		 358 aa  714    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.033604  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2602  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  57.39 
 
 		 358 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3983  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  56.94 
 
 		 354 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.156548 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3536  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  56.94 
 
 		 354 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0480036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2606  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.3 
 
 		 348 aa  308  9e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.35467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3987  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.7 
 
 		 348 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3532  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.7 
 
 		 348 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.304569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1550  hypothetical protein  46.84 
 
 		 347 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00115977  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3346  hypothetical protein  46.96 
 
 		 354 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7180  desulfurizing enzyme  46.57 
 
 		 344 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.857064  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5652  hypothetical protein  45.91 
 
 		 344 aa  275  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.777199 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5654  hypothetical protein  43.64 
 
 		 346 aa  275  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2525  hypothetical protein  44.41 
 
 		 360 aa  266  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0147  putative desulfurizing enzyme  44.71 
 
 		 354 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.975202  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3347  hypothetical protein  43.86 
 
 		 352 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7801  hypothetical protein  43.44 
 
 		 368 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3341  hypothetical protein  40.92 
 
 		 353 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1565  monooxygenase, putative  38.75 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3816  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.41 
 
 		 344 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.442978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1546  hypothetical protein  32.04 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.062934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1391  hypothetical protein  33.03 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000110401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1041  desulfurizing enzyme  39.13 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3874  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.8 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.63 
 
 		 332 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3886  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.54 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3398  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  24.9 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.860812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2061  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.3 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0563567  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1743  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  24.82 
 
 		 306 aa  47.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00139756  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6519  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.42 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6753  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.42 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0691662 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4562  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.53 
 
 		 355 aa  47  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0134  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.78 
 
 		 366 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0481  NMT1/THI5 like domain protein  21.74 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6342  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.04 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7236  ABC sulfate ester transporter, periplasmic ligand binding protein  31.68 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.82896 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4344  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.84 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252386  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3502  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.06 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0829202  decreased coverage  0.000183537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19500  hypothetical protein  25.15 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4022  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.84 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4036  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.39 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1678  hypothetical protein  25.15 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7503  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, aliphatic sulphonates  26.02 
 
 		 353 aa  42.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00283351  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2967  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  20.6 
 
 		 328 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>