More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3942 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  99.3 
 
 
143 aa  279  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  99.3 
 
 
143 aa  279  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  98.6 
 
 
143 aa  277  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  97.9 
 
 
143 aa  276  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  71.94 
 
 
140 aa  205  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  70 
 
 
145 aa  204  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  67.63 
 
 
140 aa  200  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  69.01 
 
 
143 aa  192  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  66.91 
 
 
140 aa  188  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  66.91 
 
 
140 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  66.19 
 
 
140 aa  185  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  56.43 
 
 
140 aa  176  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  69.01 
 
 
143 aa  175  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  54.68 
 
 
141 aa  153  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  55.4 
 
 
141 aa  152  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  54.68 
 
 
141 aa  148  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  55.4 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  53.96 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  53.9 
 
 
175 aa  142  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  49.28 
 
 
143 aa  140  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  48.55 
 
 
153 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  46.43 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  49.29 
 
 
141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  47.14 
 
 
145 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  49.29 
 
 
141 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  49.29 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  47.14 
 
 
145 aa  124  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  43.88 
 
 
143 aa  122  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1469  AsnC family transcriptional regulator  47.14 
 
 
145 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  47.48 
 
 
144 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3916  transcriptional regulator, AsnC family  45.77 
 
 
145 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.94143 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0901  AsnC family transcriptional regulator  46.43 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3628  transcriptional regulator, AsnC family  46.48 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.568388  normal  0.0860677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  47.86 
 
 
153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0844  AsnC family transcriptional regulator  46.43 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.837242  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  47.14 
 
 
153 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3494  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
138 aa  116  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  47.14 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3964  AsnC family transcriptional regulator  49.29 
 
 
145 aa  114  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  46.04 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  44.93 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  42.66 
 
 
153 aa  107  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  44.2 
 
 
153 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
151 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
142 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  43.8 
 
 
143 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  40.44 
 
 
164 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  42.75 
 
 
146 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  42.34 
 
 
147 aa  103  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  38.97 
 
 
153 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  41.73 
 
 
149 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
159 aa  100  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
154 aa  98.6  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
154 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
154 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
154 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
154 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
154 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
154 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 
149 aa  97.8  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
148 aa  97.4  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  42.86 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
193 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
193 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  39.71 
 
 
169 aa  94.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 
295 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 
152 aa  93.6  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
143 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  42.65 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
142 aa  90.1  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  38.24 
 
 
152 aa  89.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 
143 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  37.12 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  33.08 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
142 aa  82  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
170 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
170 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  38.52 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3986  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>