73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3930 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3590  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  99.71 
 
 
341 aa  679    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102161  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3930  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 
341 aa  682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2525  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  92.96 
 
 
338 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74884  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5326  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  94.62 
 
 
338 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3496  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  94.01 
 
 
338 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0231638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6690  putative periplasmic substrate-binding subunit (ABC transporter)  55.31 
 
 
338 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0054  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  50.79 
 
 
338 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0054  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  49.52 
 
 
338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_003296  RS03032  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  47.15 
 
 
346 aa  298  7e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.08661 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4122  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  46.43 
 
 
342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4009  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  46.43 
 
 
342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368962  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4505  NLPA lipoprotein  39.1 
 
 
342 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.826664  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5990  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.79 
 
 
341 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.626097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1728  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.9 
 
 
333 aa  226  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3152  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.54 
 
 
335 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3889  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.22 
 
 
335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  0.125658 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  35.14 
 
 
345 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00383664  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0138  NLPA lipoprotein  36.22 
 
 
341 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1606  NLPA lipoprotein  36.39 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000297803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5095  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  94.12 
 
 
119 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.296668  normal  0.288347 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30920  ABC transporter, periplasmic binding protein  36 
 
 
343 aa  212  9e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34770  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  36.72 
 
 
340 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.429191  normal  0.0167014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0512  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.61 
 
 
366 aa  209  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3151  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.12 
 
 
330 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4137  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  36 
 
 
341 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19179  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3888  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.78 
 
 
330 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6244  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  37.03 
 
 
334 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5060  ABC transporter substrate-binding protein  35.13 
 
 
327 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2677  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.73 
 
 
343 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.97 
 
 
350 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3450  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38 
 
 
343 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302208  hitchhiker  0.000774086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2170  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.08 
 
 
350 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541715  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0340  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.72 
 
 
339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0170  ABC transporter, periplasmic binding protein  33.96 
 
 
339 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0191  ABC transporter periplasmic-binding protein  33.64 
 
 
339 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4888  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  34.64 
 
 
332 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.962716  normal  0.144986 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3603  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.85 
 
 
350 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5057  ABC transporter, periplasmic binding protein  33.33 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1120  ABC transporter, periplasmic binding protein  35.74 
 
 
334 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1399  ABC transporter periplasmic binding protein  32.93 
 
 
341 aa  196  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1797  ABC transporter periplasmic binding protein  32.34 
 
 
340 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2205  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.11 
 
 
337 aa  195  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0536  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  33.98 
 
 
342 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00532956  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30880  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.96 
 
 
339 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6535  ABC transporter substrate binding protein  36 
 
 
351 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3455  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  33.11 
 
 
347 aa  192  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500568  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1388  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.39 
 
 
317 aa  192  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1244  ABC transporter substrate binding protein  35.67 
 
 
343 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803249  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6192  ABC transporter substrate binding protein  35.67 
 
 
343 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6250  ABC transporter substrate binding protein  35.58 
 
 
351 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126747  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6588  ABC transporter substrate binding protein  35.67 
 
 
343 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5982  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.79 
 
 
334 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5195  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.94 
 
 
339 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0189  ABC transporter, periplasmic binding protein  32.89 
 
 
339 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.366153 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1299  ABC transporter periplasmic binding protein  33.66 
 
 
362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6049  ABC transporter substrate binding protein  35 
 
 
351 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2032  ABC transporter substrate binding protein  32.68 
 
 
348 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1687  ABC transporter substrate binding protein  32.68 
 
 
348 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0343  ABC transporter substrate-binding protein  32.68 
 
 
348 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1866  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.68 
 
 
348 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.346438  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1878  ABC transporter substrate binding protein  32.68 
 
 
348 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0818  ABC transporter substrate binding protein  32.68 
 
 
348 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106898  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3259  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  30.6 
 
 
336 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  23.91 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1974  nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein, putative  26.91 
 
 
474 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.507629  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6103  nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein, putative  26.91 
 
 
474 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.762098  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1297  putative substrate-binding protein of aliphatic sulfonate ABC transporter  23.25 
 
 
357 aa  44.3  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1998  nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein, putative  27.6 
 
 
474 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.420561  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  23.6 
 
 
328 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2664  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  33.07 
 
 
321 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4331  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.78 
 
 
330 aa  43.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  23.29 
 
 
328 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0674  ABC transporter sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  23.36 
 
 
474 aa  42.7  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.288479  normal  0.376687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>