44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3773 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3773  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.040505 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3750  hypothetical protein  98.94 
 
 
94 aa  190  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4613  hypothetical protein  98.94 
 
 
94 aa  190  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3620  hypothetical protein  85.87 
 
 
94 aa  166  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217655  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2707  hypothetical protein  64.13 
 
 
94 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2581  hypothetical protein  64.13 
 
 
94 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.559543  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  61.96 
 
 
94 aa  120  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0524925 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2660  hypothetical protein  61.96 
 
 
94 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935328  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2049  hypothetical protein  61.96 
 
 
94 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2689  hypothetical protein  60.87 
 
 
94 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6317  hypothetical protein  50.54 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1974  hypothetical protein  39.08 
 
 
193 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.342868  normal  0.816033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  39.33 
 
 
615 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0552  hypothetical protein  45.05 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3309  hypothetical protein  38.64 
 
 
191 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0639  hypothetical protein  42.55 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03735  hypothetical protein  40.22 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1854  hypothetical protein  40.7 
 
 
101 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000134574  hitchhiker  0.0000000000036226 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6901  hypothetical protein  39.36 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4177  hypothetical protein  39.78 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.977344 
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  38.3 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  36 
 
 
173 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1810  PAAR repeat-containing protein  40 
 
 
87 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316839  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2607  hypothetical protein  36.84 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3774  hypothetical protein  33.75 
 
 
194 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  34.52 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3384  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  38.67 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  33.33 
 
 
178 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0441  hypothetical protein  34.67 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0266  hypothetical protein  29.63 
 
 
203 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  32.26 
 
 
175 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  34.52 
 
 
94 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  36.49 
 
 
453 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  37.33 
 
 
176 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1060  hypothetical protein  29.03 
 
 
193 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.158386  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  30.38 
 
 
92 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  36 
 
 
188 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  31.58 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3540  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.93294  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5089  hypothetical protein  30.67 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3252  PAAR repeat-containing protein  32.1 
 
 
86 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447164  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  31.58 
 
 
135 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>