More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3737 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0217  putative methyl-accepting chemotaxis protein  81.54 
 
 
558 aa  870    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2542  methyl-accepting chemotaxis protein  81.5 
 
 
546 aa  851    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3979  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.49 
 
 
541 aa  650    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0968  methyl-accepting chemotaxis transducer  81.54 
 
 
558 aa  870    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2308  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  91.94 
 
 
558 aa  996    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1398  putative methyl-accepting chemotaxis protein  81.44 
 
 
555 aa  866    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3737  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
558 aa  1116    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.861166  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0501  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  81 
 
 
558 aa  885    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1595  putative methyl-accepting chemotaxis protein  81.44 
 
 
555 aa  866    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4946  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  90.5 
 
 
558 aa  988    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143114  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  90.14 
 
 
558 aa  962    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0772371  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2687  methyl-accepting chemotaxis protein  81.5 
 
 
546 aa  851    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4577  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.64 
 
 
558 aa  1112    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0254  putative methyl-accepting chemotaxis protein  81.5 
 
 
546 aa  851    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  90.32 
 
 
558 aa  962    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.613268  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3786  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.64 
 
 
558 aa  1112    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.253027 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  72.22 
 
 
558 aa  762    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3973  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.75 
 
 
606 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259305  normal  0.0136642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1052  chemotaxis sensory transducer  57.09 
 
 
540 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1303  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  58.49 
 
 
540 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00176405 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3653  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  57.2 
 
 
539 aa  525  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.44224  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1488  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.8 
 
 
540 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159375  normal  0.199661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.8 
 
 
540 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4130  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.76 
 
 
540 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.138218  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1093  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.16 
 
 
540 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196472  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1429  putative chemotaxis transducer  56.64 
 
 
542 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1493  methyl-accepting chemotaxis protein  56.96 
 
 
540 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16430  putative chemotaxis transducer  55.45 
 
 
542 aa  505  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.889289  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.82 
 
 
411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0232938 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1462  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.15 
 
 
564 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1436  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.15 
 
 
564 aa  293  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1661  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  42.7 
 
 
622 aa  259  9e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1674  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  34.81 
 
 
696 aa  203  6e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.266076  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.67 
 
 
544 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 
525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  29.13 
 
 
544 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0210  methyl-accepting chemotaxis protein  24.77 
 
 
543 aa  167  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000824359  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  29.91 
 
 
541 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.13 
 
 
673 aa  165  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.7 
 
 
549 aa  164  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.11 
 
 
519 aa  164  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.418042  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.84 
 
 
549 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.85 
 
 
571 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.82 
 
 
540 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.67 
 
 
679 aa  162  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.88 
 
 
598 aa  160  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.28 
 
 
519 aa  160  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  32.05 
 
 
541 aa  159  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 
661 aa  158  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.9 
 
 
660 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  33.43 
 
 
539 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  31.74 
 
 
549 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.22 
 
 
557 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  28.73 
 
 
541 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  28.73 
 
 
541 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  29.24 
 
 
549 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.75 
 
 
528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.18 
 
 
540 aa  154  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.91 
 
 
612 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0159313  normal  0.0166963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  29.1 
 
 
549 aa  153  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.15 
 
 
666 aa  153  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  29.61 
 
 
543 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.23 
 
 
540 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.34 
 
 
474 aa  153  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000647381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.26 
 
 
547 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.43 
 
 
525 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.49 
 
 
547 aa  153  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  28.04 
 
 
541 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.05 
 
 
830 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.37 
 
 
541 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.64 
 
 
541 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0341  methyl-accepting chemotaxis protein  24.2 
 
 
574 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.11 
 
 
637 aa  151  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.87 
 
 
539 aa  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.14 
 
 
535 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  28.46 
 
 
660 aa  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  28.46 
 
 
660 aa  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.63 
 
 
550 aa  151  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.27 
 
 
807 aa  151  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.52 
 
 
537 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.21 
 
 
660 aa  150  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.8 
 
 
547 aa  150  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  28.39 
 
 
660 aa  150  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  28.39 
 
 
660 aa  150  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  28.39 
 
 
660 aa  150  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.81 
 
 
542 aa  150  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  28.39 
 
 
660 aa  150  8e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  28.39 
 
 
660 aa  150  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.29 
 
 
541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.15 
 
 
535 aa  148  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.56 
 
 
542 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.64 
 
 
570 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  28.11 
 
 
541 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.18 
 
 
533 aa  147  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1417  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.68 
 
 
554 aa  147  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37293  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.61 
 
 
693 aa  147  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.73 
 
 
540 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.88 
 
 
571 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.81 
 
 
539 aa  146  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.19 
 
 
541 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>