56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3549 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3549  aminoglycoside resistance protein  100 
 
 		 327 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2105  aminoglycoside resistance protein  79.39 
 
 		 263 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5656  3''-adenylyltransferase  59.32 
 
 		 269 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0144  aminoglycoside resistance protein  58.7 
 
 		 335 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.397995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0065  aminoglycoside resistance protein  57.49 
 
 		 263 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.577085 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0135  aminoglycoside resistance protein  57.49 
 
 		 267 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0063  aminoglycoside resistance protein  58.3 
 
 		 263 aa  292  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2178  aminoglycoside resistance protein  54.12 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120718  normal  0.0590756 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1354  aminoglycoside resistance protein  43.18 
 
 		 289 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000229675  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1916  aminoglycoside resistance protein  43.18 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000483855  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1370  aminoglycoside resistance protein  42.8 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  hitchhiker  0.000262093 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1385  aminoglycoside resistance protein  43.18 
 
 		 289 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.206124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2808  DNA polymerase beta domain protein region  35.88 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1748  3'-adenylyltransferase  34.22 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.193296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0040  3'-adenylyltransferase  34.22 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1714  3''-adenylyltransferase  34.22 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0040  3''-adenylyltransferase  34.22 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1344  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  34.22 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.166071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1221  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  34.22 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2509  streptomycin 3''-adenylyltransferase  34.22 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3874  streptomycin 3''-adenylyltransferase  61.18 
 
 		 151 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0636766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0956  3''-adenylyltransferase  34.51 
 
 		 260 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1735  adenylyltransferase  39.64 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000530526  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0092  hypothetical protein  33.2 
 
 		 273 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.479287  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3372  streptomycin 3''-adenylyltransferase  65.66 
 
 		 131 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5877  streptomycin 3''-adenylyltransferase  36.48 
 
 		 260 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0161  adenyltransferase  50 
 
 		 136 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.620989  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4803  adenylyltransferase  37.56 
 
 		 236 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318391  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20670  nucleotidyltransferase family protein  35.45 
 
 		 254 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117962  normal  0.282766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0978  hypothetical protein  31.92 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1803  DNA polymerase beta domain protein region  25.1 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0454  hypothetical protein  32.63 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3186  hypothetical protein  25 
 
 		 195 aa  53.1  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1217  ABC transporter related  80.65 
 
 		 540 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322449  normal  0.502892 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2078  ABC transporter related  80.65 
 
 		 540 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0240438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6018  ABC transporter related  80.65 
 
 		 540 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.685553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1961  ABC transporter related  80.65 
 
 		 540 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323177  normal  0.323319 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2091  ABC transporter related  80.65 
 
 		 540 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  76.47 
 
 		 544 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2059  ABC transporter related  80.65 
 
 		 540 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0427547  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5368  ABC transporter, ATPase subunit  80.65 
 
 		 540 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3207  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  83.33 
 
 		 549 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000664332  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2490  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  83.33 
 
 		 549 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0280689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2544  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  83.33 
 
 		 549 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1604  ABC transporter, ATP-binding protein  83.33 
 
 		 549 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000882575  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1379  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  83.33 
 
 		 549 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2631  ABC transporter, ATP-binding protein  83.33 
 
 		 549 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000111605  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2106  peptide/opine/nickel uptake ABC transporter ATP-binding protein  83.33 
 
 		 549 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00388823  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2498  ABC transporter related  80 
 
 		 544 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000299365  normal  0.0176936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1380  ABC transporter related  80 
 
 		 539 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0115992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1639  ABC peptide transporter, ATPase subunit  80 
 
 		 543 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0125273  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  75 
 
 		 530 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.89 
 
 		 671 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4502  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  68.75 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2814  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  35.58 
 
 		 340 aa  43.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.241348  normal  0.0563642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  46.81 
 
 		 535 aa  43.1  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>