More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3490 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4554  major facilitator transporter  94.94 
 
 		 435 aa  808    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3490  major facilitator transporter  100 
 
 		 435 aa  868    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000252104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4332  major facilitator transporter  99.31 
 
 		 435 aa  863    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.206712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4034  major facilitator transporter  99.31 
 
 		 435 aa  863    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2144  major facilitator transporter  59.27 
 
 		 437 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.129107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3575  major facilitator transporter  58.2 
 
 		 437 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.314754  normal  0.535313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3940  major facilitator family transporter  57.97 
 
 		 437 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.100608  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1897  major facilitator transporter  57.74 
 
 		 488 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  57.28 
 
 		 435 aa  468  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1431  major facilitator superfamily MFS_1  56.34 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  50.91 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  49.54 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  50.36 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 441 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  50.91 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  48.97 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  49.08 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 441 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  49.54 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  50 
 
 		 443 aa  425  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  47.84 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 441 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 436 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  50.81 
 
 		 442 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  49.16 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  49.16 
 
 		 440 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  49.16 
 
 		 440 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  47.7 
 
 		 437 aa  418  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  51.08 
 
 		 444 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  49.16 
 
 		 440 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 452 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  49.65 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  49.16 
 
 		 440 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  49.16 
 
 		 440 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  52.05 
 
 		 434 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  52.05 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  49.16 
 
 		 469 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  48.48 
 
 		 437 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 439 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  47.36 
 
 		 451 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  52.29 
 
 		 434 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  49.3 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  52.29 
 
 		 434 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  51.57 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  52.29 
 
 		 434 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  48.92 
 
 		 442 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  46.88 
 
 		 443 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  50.36 
 
 		 440 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  47.38 
 
 		 445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  46.73 
 
 		 442 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  50.23 
 
 		 435 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  46.99 
 
 		 433 aa  405  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  47.48 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.1 
 
 		 439 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  46.99 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  46.87 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  48.39 
 
 		 477 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  48.8 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  49.04 
 
 		 433 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  51.57 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  49.28 
 
 		 442 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  49.77 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  49.77 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  49.77 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1233  major facilitator family transporter  49.77 
 
 		 435 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  48.6 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  49.77 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1075  major facilitator superfamily permease  49.77 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  46.62 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  48.24 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  46.85 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  49.77 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  48.24 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  45.45 
 
 		 441 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  48.01 
 
 		 441 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  44.96 
 
 		 440 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  44.24 
 
 		 441 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1635  major facilitator transporter  47.73 
 
 		 433 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000373492  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  45.09 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 442 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  45.33 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  44.19 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  46.79 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  44.19 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  44.19 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  46.17 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0200  major facilitator family transporter  45.23 
 
 		 441 aa  362  6e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1636  MFS transporter  45 
 
 		 441 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0172  major facilitator family transporter  45 
 
 		 441 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0261  major facilitator superfamily permease  44.77 
 
 		 441 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  45.84 
 
 		 445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  44.72 
 
 		 441 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 		 452 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3111  major facilitator transporter  40.97 
 
 		 455 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>