More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3336 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0268  gamma-glutamyltranspeptidase  85.74 
 
 
573 aa  1009    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0755298  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3336  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
573 aa  1165    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4659  gamma-glutamyltransferase  61.6 
 
 
555 aa  665    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1823  gamma-glutamyltransferase  85.91 
 
 
573 aa  1011    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.496785  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1616  gamma-glutamyltransferase  68.72 
 
 
592 aa  774    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.642226  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0996  gamma-glutamyltranspeptidase  85.74 
 
 
573 aa  1009    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.030898  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4301  gamma-glutamyltransferase  80.34 
 
 
577 aa  956    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.450186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2484  gamma-glutamyltransferase  63.45 
 
 
557 aa  682    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4068  gamma-glutamyltransferase  97.03 
 
 
573 aa  1140    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00343231  normal  0.979894 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0297  gamma-glutamyltransferase  85.74 
 
 
573 aa  1011    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.58924  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2827  gamma-glutamyltransferase  64.51 
 
 
584 aa  730    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0328674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4521  gamma-glutamyltransferase  61.41 
 
 
555 aa  664    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.229347  normal  0.483178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4047  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  62.76 
 
 
557 aa  673    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559843  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1850  gamma-glutamyltransferase 1  98.6 
 
 
573 aa  1151    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.186583 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1134  gamma-glutamyltransferase  86.26 
 
 
573 aa  1013    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1739  gamma-glutamyltransferase  85.91 
 
 
573 aa  1011    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4414  gamma-glutamyltransferase  96.86 
 
 
573 aa  1139    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3857  gamma-glutamyltransferase  80.04 
 
 
585 aa  931    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168066  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1308  gamma-glutamyltransferase 1  64.5 
 
 
584 aa  734    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0629  gamma-glutamyltransferase 1  79.48 
 
 
577 aa  941    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.495929  decreased coverage  0.00747433 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4185  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
573 aa  1165    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0777  gamma-glutamyltransferase  59.71 
 
 
555 aa  659    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1328  gamma-glutamyltranspeptidase  85.74 
 
 
573 aa  1009    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600638  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4654  gamma-glutamyltransferase  61.41 
 
 
555 aa  662    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3593  gamma-glutamyltransferase  97.21 
 
 
573 aa  1143    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46960  gamma-glutamyltranspeptidase precursor  62.94 
 
 
557 aa  675    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.199873  normal  0.0147072 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4181  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
573 aa  1165    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0371  gamma-glutamyltranspeptidase  85.74 
 
 
573 aa  1009    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.220904  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1715  gamma-glutamyltransferase  52.54 
 
 
576 aa  550  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1885  gamma-glutamyltransferase  53.4 
 
 
567 aa  543  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00590  gamma-glutamyltranspeptidase  51.97 
 
 
576 aa  541  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  47.22 
 
 
556 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  47.22 
 
 
556 aa  455  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1176  gamma-glutamyltransferase 1  46.17 
 
 
645 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0385  gamma-glutamyltransferase 1  46.08 
 
 
576 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1952  gamma-glutamyltranspeptidase  43.33 
 
 
579 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  44.83 
 
 
586 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  45.72 
 
 
580 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3731  gamma-glutamyltransferase  43.99 
 
 
571 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  45.24 
 
 
583 aa  432  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  45.42 
 
 
645 aa  432  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  44.22 
 
 
588 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2297  gamma-glutamyltransferase 1  43.92 
 
 
579 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0286048  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2369  gamma-glutamyltransferase 1  43.75 
 
 
579 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0712911  normal  0.345886 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2487  gamma-glutamyltransferase 1  43.75 
 
 
579 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.395225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  44.29 
 
 
580 aa  428  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  46.36 
 
 
581 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2620  gamma-glutamyltransferase  44.93 
 
 
579 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1864  gamma-glutamyltransferase  43.56 
 
 
599 aa  428  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  44.16 
 
 
580 aa  428  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1667  gamma-glutamyltransferase  44.99 
 
 
579 aa  427  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505372  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  44.16 
 
 
580 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2658  gamma-glutamyltransferase  45.11 
 
 
579 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0212012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1727  gamma-glutamyltransferase  45.11 
 
 
579 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0612761  normal  0.0127871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2108  gamma-glutamyltransferase  45.87 
 
 
587 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2733  gamma-glutamyltransferase  45.11 
 
 
579 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215634  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  42.6 
 
 
581 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  45.97 
 
 
575 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1173  gamma-glutamyltransferase  45.33 
 
 
588 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0347594  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  45.63 
 
 
590 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1373  gamma-glutamyltransferase  44.3 
 
 
617 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  43.99 
 
 
580 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  45.22 
 
 
580 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  45.56 
 
 
575 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  45.22 
 
 
580 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  45.22 
 
 
580 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  45.22 
 
 
581 aa  421  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1114  gamma-glutamyltransferase 1  44.51 
 
 
589 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.827494  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  45.22 
 
 
580 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2689  gamma-glutamyltransferase  42.8 
 
 
582 aa  422  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.975732 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  42.91 
 
 
579 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  43.81 
 
 
580 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4652  gamma-glutamyltransferase  46.51 
 
 
602 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.467569  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  45.4 
 
 
577 aa  421  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  44.94 
 
 
581 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3580  gamma-glutamyltransferase  43.49 
 
 
578 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.229628 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  44.85 
 
 
580 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3281  gamma-glutamyltransferase  43.16 
 
 
578 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2120  gamma-glutamyltransferase  44.98 
 
 
606 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  45.04 
 
 
581 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4506  gamma-glutamyltransferase  43.6 
 
 
560 aa  418  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  44.16 
 
 
576 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  44.62 
 
 
576 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  44.62 
 
 
576 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  45.14 
 
 
575 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  45.77 
 
 
583 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5927  gamma-glutamyltransferase  44.44 
 
 
566 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.779153  normal  0.531425 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  45.93 
 
 
583 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  45.73 
 
 
583 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  44.27 
 
 
578 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1625  gamma-glutamyltransferase  45.87 
 
 
578 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441001  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  44.57 
 
 
587 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  43.22 
 
 
583 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4199  gamma-glutamyltransferase  42.86 
 
 
586 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0825429  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  43.24 
 
 
587 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  44.83 
 
 
583 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  43.81 
 
 
576 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1540  gamma-glutamyltransferase  43.14 
 
 
610 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00533292 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4407  gamma-glutamyltransferase  43.37 
 
 
579 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  45.03 
 
 
583 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.436981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>