87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3327 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4176  OmpW  100 
 
 
464 aa  927    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.504746  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3327  OmpW family protein  100 
 
 
464 aa  927    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.406945  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1835  OmpW family protein  87.5 
 
 
463 aa  776    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.306199  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4190  OmpW family protein  100 
 
 
464 aa  927    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1141  putative lipoprotein  56.05 
 
 
504 aa  484  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.917542  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1815  OmpW family outer membrane protein  55.6 
 
 
498 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198724  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1319  putative lipoprotein  55.85 
 
 
498 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.598416  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1731  OmpW family outer membrane protein  55.12 
 
 
498 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0288  putative lipoprotein  55.85 
 
 
498 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0277  putative lipoprotein  55.85 
 
 
498 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.561631  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1003  hypothetical protein  64.62 
 
 
277 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0426  OmpW family protein  35.9 
 
 
306 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0265216  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0411  OmpW family protein  35.53 
 
 
308 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0130302 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3858  ompW family protein  35.96 
 
 
276 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00164107  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1962  OmpW family outer membrane protein  35.96 
 
 
276 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3516  OmpW family outer membrane protein  35.96 
 
 
276 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2593  OmpW family outer membrane protein  35.96 
 
 
276 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.964687  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3525  OmpW family outer membrane protein  35.96 
 
 
276 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3797  ompW family protein  35.96 
 
 
276 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.00000000000517916  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0026  OmpW family outer membrane protein  35.96 
 
 
276 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000541983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3131  OmpW family outer membrane protein  35.96 
 
 
276 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3117  OmpW family outer membrane protein  35.27 
 
 
276 aa  156  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00001264  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0273  OmpW family outer membrane porin  34.38 
 
 
274 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000012547  unclonable  0.000000709917 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3443  OmpW  35.27 
 
 
282 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.021221  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0291  OmpW family protein  33.81 
 
 
277 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251819  unclonable  0.0000000000417391 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0214  OmpW family protein  33.81 
 
 
277 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000152591  unclonable  0.00000000000991303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2795  OmpW  33.45 
 
 
277 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134393  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3683  OmpW family protein  33.33 
 
 
274 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000286443  unclonable  0.0000000000000106929 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0311  OmpW family protein  33.45 
 
 
277 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000300179  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3410  OmpW family protein  33.1 
 
 
277 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000136478  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0238  OmpW family protein  32.74 
 
 
277 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000689668  unclonable  0.0000000000300165 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0230  OmpW family protein  32.74 
 
 
277 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000579119  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3591  outer membrane protein OmpW  34.38 
 
 
286 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.921403  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0546  OmpW family protein  31.6 
 
 
274 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4515  OmpW family protein  31.6 
 
 
274 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144856  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5040  OmpW family protein  31.6 
 
 
274 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.29501  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5103  OmpW family protein  31.25 
 
 
274 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5178  OmpW family protein  31.25 
 
 
274 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3265  OmpW  31.25 
 
 
274 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1433  OmpW family outer membrane protein  33.06 
 
 
274 aa  126  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2417  OmpW family protein  32.64 
 
 
274 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.729819  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2023  OmpW family protein  32.29 
 
 
274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  0.457638 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1875  OmpW family outer membrane protein  31.05 
 
 
290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.253498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0901  OmpW family outer membrane protein  31.05 
 
 
290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3131  OmpW family outer membrane protein  31.05 
 
 
290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2734  OmpW family outer membrane protein  31.05 
 
 
290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.355181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2010  OmpW family outer membrane protein  31.05 
 
 
274 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3185  OmpW family outer membrane protein  30.71 
 
 
274 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0684356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3168  OmpW family outer membrane protein  30.32 
 
 
290 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2349  OmpW family protein  24.32 
 
 
382 aa  92.8  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.306712 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3378  OmpW  27.84 
 
 
241 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.68852  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3221  OmpW family protein  26.28 
 
 
239 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3545  OmpW family protein  26.28 
 
 
239 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.506265 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2401  putative outer membrane protein  25.38 
 
 
371 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.675922 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3350  putative outer membrane W signal peptide protein  26.81 
 
 
241 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3526  outer membrane protein OmpW  24.4 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0989  OmpW family protein  26.94 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3593  OmpW family protein  25.91 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192087  hitchhiker  0.00000065316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0363  OmpW family outer membrane porin  26.18 
 
 
241 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814411  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3509  OmpW family protein  26.67 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5778  OmpW family protein  26.94 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.923655 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5082  OmpW  26.94 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133195  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4400  OmpW family protein  26.94 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2738  OmpW family outer membrane protein  24.89 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3214  OmpW family outer membrane protein  24.89 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3720  OmpW family outer membrane protein  24.89 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3016  OmpW family outer membrane protein  25.32 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1765  OmpW family outer membrane protein  24.89 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3692  ompW family protein  24.89 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3750  ompW family protein  24.89 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2789  OmpW family outer membrane protein  24.89 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2790  OmpW family protein  26.18 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3528  OmpW family protein  23.22 
 
 
246 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.489275  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3497  OmpW family protein  24.05 
 
 
243 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650104  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5285  OmpW family protein  23.33 
 
 
245 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0379  OmpW family protein  24.05 
 
 
243 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736449  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0400  OmpW family protein  24.05 
 
 
243 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.869895  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2707  OmpW  24.05 
 
 
243 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0259344  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0303  OmpW family protein  22.36 
 
 
243 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128048  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0319  OmpW family protein  22.36 
 
 
243 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.108332  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0328  OmpW family protein  22.36 
 
 
243 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5811  OmpW family protein  23.28 
 
 
248 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0168261 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  25.35 
 
 
210 aa  47  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  22.04 
 
 
228 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  25.35 
 
 
210 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0319  OmpW  20.94 
 
 
233 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.110155  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  26.85 
 
 
213 aa  43.9  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0573693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>