More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3254 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3687  porin  87.68 
 
 		 405 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413134  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3254  porin  100 
 
 		 406 aa  803    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.238701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1748  outer membrane protein (porin)  95.32 
 
 		 404 aa  734    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0278155  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4327  porin  86 
 
 		 399 aa  653    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4263  porin  100 
 
 		 406 aa  803    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  normal  0.182769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4103  porin  100 
 
 		 406 aa  803    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0297241  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4160  porin  87.93 
 
 		 405 aa  694    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.396932  normal  0.277302 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1122  putative porin OpcP1  76.23 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.943534  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1720  outer membrane porin OpcP  76.47 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34502  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0957  porin  76.23 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2281  outer membrane porin  76.23 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1043  porin  75.74 
 
 		 400 aa  577  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  65.69 
 
 		 399 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6101  porin Gram-negative type  66.84 
 
 		 406 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  65.93 
 
 		 399 aa  513  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6095  porin  61.8 
 
 		 405 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7566  outer membrane protein (porin)  63.26 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0747228  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  64.18 
 
 		 405 aa  494  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6552  porin  61.65 
 
 		 406 aa  482  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.961428 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1082  porin  61.8 
 
 		 405 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464174 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5801  porin Gram-negative type  60.31 
 
 		 411 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00555584  normal  0.58755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0755  porin Gram-negative type  60.29 
 
 		 405 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.541984 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6813  porin  58.74 
 
 		 406 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0628209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5550  porin  63.66 
 
 		 409 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  46.61 
 
 		 395 aa  325  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  46.48 
 
 		 395 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  47.7 
 
 		 394 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  46.21 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  47.53 
 
 		 398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  46.74 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  44.56 
 
 		 394 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  44.53 
 
 		 421 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  44.53 
 
 		 421 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  43.86 
 
 		 397 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  44.2 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  45.24 
 
 		 445 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  43.13 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  43.37 
 
 		 397 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  44.33 
 
 		 411 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  42.27 
 
 		 397 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  42.58 
 
 		 402 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1082  porin transmembrane protein  41.97 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000550491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  41.39 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  41.39 
 
 		 399 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  41.39 
 
 		 399 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  41.39 
 
 		 399 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  41.39 
 
 		 399 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  41.6 
 
 		 391 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  40.44 
 
 		 389 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  39.36 
 
 		 436 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  39.36 
 
 		 436 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  39.85 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  39.85 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  39.85 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  39.85 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  39.85 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  40.54 
 
 		 383 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  39.61 
 
 		 386 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  41.32 
 
 		 385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  40.44 
 
 		 383 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  41.08 
 
 		 385 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  41.75 
 
 		 390 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  39.8 
 
 		 383 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  39.8 
 
 		 383 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  41.26 
 
 		 390 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  41.94 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  38.93 
 
 		 390 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  40 
 
 		 386 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  41.97 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  40 
 
 		 386 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  40 
 
 		 386 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  42.68 
 
 		 386 aa  229  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  42.3 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  40.58 
 
 		 430 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  39.64 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  39.02 
 
 		 386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  39.02 
 
 		 386 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  40.34 
 
 		 430 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  40.34 
 
 		 430 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  39.02 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  42.23 
 
 		 523 aa  225  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  40.24 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  39.66 
 
 		 387 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  40.1 
 
 		 430 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  40.1 
 
 		 430 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  40.1 
 
 		 430 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  41.24 
 
 		 390 aa  222  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  38.57 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  40.93 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  40.93 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  41.75 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  39.28 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  39.43 
 
 		 393 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  41.12 
 
 		 385 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  41.12 
 
 		 385 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  41.99 
 
 		 385 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  38.36 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  40.41 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  40.34 
 
 		 386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  35.9 
 
 		 389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>