268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3215 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  100 
 
 
319 aa  659  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
319 aa  659  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  95.92 
 
 
339 aa  635  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  97.49 
 
 
319 aa  645  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
336 aa  659  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  97.49 
 
 
319 aa  646  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  95.61 
 
 
339 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  91.51 
 
 
319 aa  606  1e-172  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.73109e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  90.57 
 
 
319 aa  601  1e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  2.19811e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  90.88 
 
 
319 aa  602  1e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  86.79 
 
 
319 aa  585  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  86.52 
 
 
319 aa  575  1e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  87.74 
 
 
319 aa  573  1e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  87.74 
 
 
319 aa  573  1e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  84.33 
 
 
319 aa  569  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  76.42 
 
 
335 aa  516  1e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  76.42 
 
 
335 aa  516  1e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  67.72 
 
 
321 aa  458  1e-128  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  66.16 
 
 
329 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  65.19 
 
 
318 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  65.82 
 
 
318 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  65.82 
 
 
318 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  65.82 
 
 
318 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  65.82 
 
 
318 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  65.82 
 
 
318 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  65.82 
 
 
318 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  65.82 
 
 
318 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  62.46 
 
 
321 aa  416  1e-115  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  59.94 
 
 
321 aa  404  1e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  60.57 
 
 
319 aa  399  1e-110  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  1.47099e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  59.75 
 
 
317 aa  400  1e-110  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  59.31 
 
 
332 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  58.81 
 
 
319 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  57.23 
 
 
318 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  58.18 
 
 
317 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  57.23 
 
 
316 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  56.6 
 
 
316 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  55.21 
 
 
318 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  54.72 
 
 
317 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  55.35 
 
 
316 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  53.46 
 
 
316 aa  355  4e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  53.14 
 
 
316 aa  354  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  63.81 
 
 
264 aa  332  5e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  49.05 
 
 
321 aa  315  8e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  45.96 
 
 
319 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  47.81 
 
 
320 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  47.35 
 
 
319 aa  287  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  47.81 
 
 
320 aa  283  3e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  43.93 
 
 
319 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  43.26 
 
 
322 aa  249  5e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  33.08 
 
 
298 aa  135  1e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.1498e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  35.94 
 
 
299 aa  132  8e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 
302 aa  122  1e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  32.89 
 
 
287 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  32.41 
 
 
312 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  29.28 
 
 
353 aa  112  1e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  32.16 
 
 
318 aa  105  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  32.64 
 
 
323 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 
321 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  28.69 
 
 
332 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  26.22 
 
 
292 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.386e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 
305 aa  99.8  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  29.88 
 
 
308 aa  99  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  29.46 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  30.09 
 
 
318 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  30.53 
 
 
318 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 
315 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 
321 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  29.38 
 
 
310 aa  92.8  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  28.51 
 
 
362 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  25.86 
 
 
438 aa  90.1  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  28.7 
 
 
333 aa  90.1  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 
319 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  25.95 
 
 
300 aa  89.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 
304 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  27.55 
 
 
342 aa  87  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  27.49 
 
 
637 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1030  metallo-beta-lactamase family protein  28.84 
 
 
282 aa  86.3  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00771484  hitchhiker  0.000295307 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 
337 aa  85.9  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  26.76 
 
 
312 aa  85.1  1e-15  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  29.66 
 
 
325 aa  85.1  1e-15  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  23.77 
 
 
310 aa  85.1  1e-15  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  26.24 
 
 
644 aa  85.1  1e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761321 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 
364 aa  85.5  1e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  28.63 
 
 
364 aa  84.7  2e-15  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  30.89 
 
 
307 aa  83.6  4e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2714  metallo-beta-lactamase family protein  27.88 
 
 
325 aa  83.2  5e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  27.16 
 
 
312 aa  82.8  8e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  24.23 
 
 
312 aa  82.4  1e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  29.31 
 
 
313 aa  82.4  1e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 
330 aa  81.6  1e-14  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 
307 aa  81.3  2e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
310 aa  81.3  2e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  29.87 
 
 
309 aa  80.9  3e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 
315 aa  80.5  3e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>