More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3194 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4216  porin  90.53 
 
 
380 aa  695  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  85.53 
 
 
380 aa  675  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  97.11 
 
 
380 aa  734  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  88.42 
 
 
380 aa  696  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  90.53 
 
 
380 aa  696  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  96.84 
 
 
379 aa  728  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  100 
 
 
380 aa  763  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  75.79 
 
 
411 aa  572  1e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  65.71 
 
 
384 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  65.71 
 
 
384 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  65.45 
 
 
384 aa  507  1e-142  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  65.45 
 
 
384 aa  507  1e-142  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  65.45 
 
 
384 aa  507  1e-142  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  65.45 
 
 
384 aa  507  1e-142  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  64.94 
 
 
384 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  61.4 
 
 
383 aa  469  1e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  62.34 
 
 
383 aa  465  1e-130  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  60.77 
 
 
390 aa  467  1e-130  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  64.29 
 
 
383 aa  461  1e-128  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  63.33 
 
 
409 aa  454  1e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  59.85 
 
 
391 aa  445  1e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  53.03 
 
 
379 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  52.03 
 
 
379 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  52.03 
 
 
379 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  51.78 
 
 
379 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  4.14234e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  52.03 
 
 
379 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  3.37977e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  53.42 
 
 
383 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  52.03 
 
 
379 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  52.54 
 
 
383 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  53.12 
 
 
374 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  50.25 
 
 
379 aa  362  6e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  50.88 
 
 
381 aa  362  7e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  5.10275e-08  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  51.52 
 
 
380 aa  356  4e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  51.26 
 
 
380 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  9.49722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  50.5 
 
 
381 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  49.37 
 
 
383 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  48.86 
 
 
383 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  50.87 
 
 
381 aa  345  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  49.12 
 
 
384 aa  345  9e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  51.19 
 
 
379 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  50.25 
 
 
381 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  48.97 
 
 
375 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  49.48 
 
 
375 aa  328  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  48.71 
 
 
375 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  48.71 
 
 
375 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  50.13 
 
 
384 aa  326  4e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  47 
 
 
384 aa  320  2e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  47 
 
 
384 aa  320  2e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  47 
 
 
384 aa  320  2e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  47 
 
 
384 aa  320  2e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  47 
 
 
384 aa  320  2e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  47 
 
 
384 aa  320  2e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  47 
 
 
384 aa  320  2e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  46.87 
 
 
383 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  46.75 
 
 
414 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  49.18 
 
 
375 aa  316  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  48.87 
 
 
392 aa  315  1e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  47.37 
 
 
391 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  48.97 
 
 
377 aa  305  1e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  47.12 
 
 
409 aa  305  1e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  47.12 
 
 
409 aa  305  1e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  48.32 
 
 
377 aa  303  3e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  47.01 
 
 
387 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  45.62 
 
 
385 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  43.78 
 
 
376 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  48.59 
 
 
363 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  43.83 
 
 
383 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  45.65 
 
 
384 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  44.53 
 
 
396 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  45.38 
 
 
384 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  45.38 
 
 
384 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  45.38 
 
 
384 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  43.69 
 
 
381 aa  289  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  44.47 
 
 
394 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  45.12 
 
 
384 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  48.33 
 
 
362 aa  287  3e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  48.33 
 
 
362 aa  287  3e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  44.85 
 
 
384 aa  287  3e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  48.33 
 
 
362 aa  287  3e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  44.23 
 
 
394 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  44.23 
 
 
394 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  49.1 
 
 
361 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  45.12 
 
 
384 aa  285  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  47.06 
 
 
374 aa  285  1e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  47.06 
 
 
374 aa  285  1e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  43.98 
 
 
394 aa  285  1e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  44.84 
 
 
385 aa  285  1e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  44.06 
 
 
386 aa  284  2e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  43.72 
 
 
394 aa  283  3e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  47.57 
 
 
374 aa  283  3e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  44.33 
 
 
389 aa  283  5e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  45.45 
 
 
385 aa  282  7e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  45.45 
 
 
385 aa  282  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  46.68 
 
 
376 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  48.09 
 
 
372 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  46.68 
 
 
376 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  44.06 
 
 
386 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  7.30188e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  46.68 
 
 
376 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  46.68 
 
 
376 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  45.66 
 
 
383 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>