More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3111 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_3090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  85.92 
 
 		 467 aa  761    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0188  sensor histidine kinase  89.58 
 
 		 426 aa  725    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3251  sensor histidine kinase  89.58 
 
 		 426 aa  725    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0198  sensor histidine kinase  89.58 
 
 		 426 aa  725    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3111  histidine kinase  100 
 
 		 476 aa  948    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344952 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0383  sensor kinase protein  89.33 
 
 		 426 aa  724    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326302  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.65 
 
 		 434 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.541426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3435  sensor histidine kinase  89.58 
 
 		 426 aa  725    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  93.07 
 
 		 472 aa  856    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0162  sensor histidine kinase  90.32 
 
 		 426 aa  730    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2176  sensor histidine kinase  89.58 
 
 		 426 aa  725    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4383  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  80.8 
 
 		 436 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2913  sensor histidine kinase  89.58 
 
 		 426 aa  725    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340179  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  90.78 
 
 		 468 aa  803    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2480  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  98.74 
 
 		 476 aa  936    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00569401  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3141  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  90.99 
 
 		 468 aa  787    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  75.81 
 
 		 436 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3094  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  98.74 
 
 		 476 aa  936    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0688371  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.45 
 
 		 459 aa  322  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0173  sensor histidine kinase  46.83 
 
 		 451 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00702706  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0039  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  44.06 
 
 		 448 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3712  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 448 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3389  histidine kinase  44.76 
 
 		 448 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0008  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 421 aa  227  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2689  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 419 aa  206  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1642  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 479 aa  204  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2735  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 424 aa  203  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.503254  hitchhiker  0.00000000176943 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3136  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 417 aa  203  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0506729  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2977  sensor histidine kinase  33.78 
 
 		 449 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2201  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 430 aa  193  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000139866  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4051  histidine kinase  35.19 
 
 		 465 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.892917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2270  histidine kinase  34.5 
 
 		 447 aa  189  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4554  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 419 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215906  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1586  sensor histidine kinase  33.96 
 
 		 419 aa  180  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 417 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4231  sensor histidine kinase  35.45 
 
 		 419 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0820  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 420 aa  176  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.197209  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3894  histidine kinase  33.33 
 
 		 442 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.927411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0930  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0887  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 450 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12550  periplasmic sensory histidine protein kinase  33.9 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.418352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4062  histidine kinase  32.93 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.081892  normal  0.353238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5108  putative two-component sensor  35.81 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58320  putative two-component sensor  35.03 
 
 		 422 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0719781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2035  putative photosynthetic apparatus regulatory protein regB  31.85 
 
 		 450 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1739  two-component sensor histidine kinase  31.73 
 
 		 443 aa  160  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2206  histidine kinase  33.09 
 
 		 429 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.979834  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0237  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2881  putative two-component sensor  28.61 
 
 		 436 aa  153  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0738997  hitchhiker  0.00159828 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0600  ATP-binding region, ATPase-like  31.08 
 
 		 449 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4818  sensor histidine kinase  28.24 
 
 		 422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.904783  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.298182 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal  0.0755864 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0230  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 464 aa  140  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.615813  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2344  histidine kinase  30.92 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.349621  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112978 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1606  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0150845  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0110  histidine kinase  28.1 
 
 		 446 aa  131  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0152985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4318  histidine kinase  29.04 
 
 		 442 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0183324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0665  histidine kinase  29.43 
 
 		 442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 452 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 462 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100518  normal  0.877828 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1520  sensor histidine kinase PrrB (RegB)  28.57 
 
 		 462 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 422 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0602735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7659  histidine kinase  27.14 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0359  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 408 aa  123  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1503  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 435 aa  123  7e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203447  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3187  sensor histidine kinase  32.21 
 
 		 423 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0552  histidine kinase  28.72 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00798  two-component system sensor protein  30.67 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170926  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 434 aa  114  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0060  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 440 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 440 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2864  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 441 aa  109  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0537405  normal  0.483733 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2148  two-component system, sensor protein  28.57 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.113962  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4173  sensor histidine kinase  27.89 
 
 		 428 aa  108  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2779  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 462 aa  106  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5544  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0453  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 436 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1835  histidine kinase  29.01 
 
 		 459 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426972  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 448 aa  103  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.0681596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0570  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0338625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 436 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0463  histidine kinase  28.79 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0128  sensor histidine kinase  28.44 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00320906  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 461 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289635  decreased coverage  0.00139676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4070  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 416 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>