203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2893 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  98.99 
 
 
597 aa  1146    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  100 
 
 
597 aa  1158    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  98.99 
 
 
597 aa  1146    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  41.55 
 
 
967 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  41.74 
 
 
1417 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  38.15 
 
 
810 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  36.96 
 
 
1613 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  47.99 
 
 
655 aa  207  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  44.96 
 
 
536 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  45.74 
 
 
575 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  36.95 
 
 
1197 aa  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  36.95 
 
 
1197 aa  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  36.72 
 
 
1197 aa  198  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  33.45 
 
 
1204 aa  196  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  40.48 
 
 
3126 aa  193  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  39.23 
 
 
1451 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  37.84 
 
 
2832 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  38.14 
 
 
1125 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  41.16 
 
 
877 aa  187  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  57.63 
 
 
589 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  38.44 
 
 
1072 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  39.22 
 
 
2868 aa  182  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  44.3 
 
 
1390 aa  178  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  34.74 
 
 
3192 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  43.88 
 
 
2504 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  44.51 
 
 
472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  33.44 
 
 
735 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  53.45 
 
 
1440 aa  174  5e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  53.45 
 
 
1190 aa  174  5e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  36.31 
 
 
3635 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  45.64 
 
 
330 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  35.6 
 
 
990 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  35.42 
 
 
4726 aa  160  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  32.95 
 
 
820 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  32.95 
 
 
831 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  32.95 
 
 
831 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  32.95 
 
 
816 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  32.95 
 
 
816 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  32.95 
 
 
816 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  32.95 
 
 
816 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  32.79 
 
 
831 aa  156  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  37.01 
 
 
4191 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  34.25 
 
 
1246 aa  154  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  33.64 
 
 
1117 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  39.09 
 
 
3355 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  33.53 
 
 
4384 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  31.25 
 
 
1342 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  31.25 
 
 
1447 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  31.25 
 
 
1447 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  46.37 
 
 
423 aa  124  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  33.62 
 
 
1309 aa  124  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  45.21 
 
 
356 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  47.03 
 
 
880 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  38.81 
 
 
1713 aa  121  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  33.23 
 
 
1616 aa  120  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  33.23 
 
 
1616 aa  120  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  34.09 
 
 
1616 aa  120  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  45.95 
 
 
876 aa  120  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  33.55 
 
 
1549 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  32.59 
 
 
1674 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  37.12 
 
 
1090 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  37.12 
 
 
1074 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  33.23 
 
 
1588 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  37.12 
 
 
1122 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  43.36 
 
 
1516 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  37.12 
 
 
1090 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  37.12 
 
 
1090 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  37.12 
 
 
1122 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  37.12 
 
 
1122 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  33.82 
 
 
279 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  35.5 
 
 
3718 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  37.5 
 
 
963 aa  114  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  41.47 
 
 
1326 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  45.05 
 
 
1012 aa  110  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  45.05 
 
 
1068 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  36.77 
 
 
2392 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  44.51 
 
 
962 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  45.05 
 
 
1186 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  43.65 
 
 
373 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  43.65 
 
 
373 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  43.65 
 
 
192 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  43.65 
 
 
192 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  43.65 
 
 
378 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  39.69 
 
 
378 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  35.96 
 
 
492 aa  104  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  39.18 
 
 
460 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  46.41 
 
 
898 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  40.22 
 
 
737 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  33.47 
 
 
1916 aa  101  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  31.58 
 
 
2095 aa  98.2  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  36.07 
 
 
1854 aa  96.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  30.79 
 
 
1814 aa  96.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0180  YadA domain protein  26.39 
 
 
1230 aa  94.4  6e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3593  YadA domain protein  41.67 
 
 
742 aa  93.2  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50488  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  36.9 
 
 
533 aa  91.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  41.76 
 
 
617 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3661  hemagluttinin-like protein  41.89 
 
 
418 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0725058  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  43.06 
 
 
1654 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  41.48 
 
 
827 aa  89.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  43.48 
 
 
2396 aa  89.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>