65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2711 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  89.89 
 
 		 378 aa  647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  100 
 
 		 360 aa  735    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  99.72 
 
 		 360 aa  734    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  93.33 
 
 		 360 aa  691    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  91.47 
 
 		 340 aa  646    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  99.72 
 
 		 360 aa  734    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  65.69 
 
 		 358 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  57.99 
 
 		 363 aa  404  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  51.58 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  51.3 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  50.86 
 
 		 363 aa  361  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  49 
 
 		 362 aa  332  5e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.08 
 
 		 765 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  47.89 
 
 		 344 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  39.21 
 
 		 475 aa  262  8.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  38.27 
 
 		 330 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  34.86 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  30 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  29.2 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  31.3 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  29.67 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  28.52 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  29.63 
 
 		 540 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  29.48 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  29.55 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  29.55 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  29.55 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  29.55 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  28.34 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0916  fatty acid desaturase  29.25 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0674  fatty acid desaturase  26.94 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2952  fatty acid desaturase  24.13 
 
 		 361 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3886  Fatty acid desaturase  26.83 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  25.63 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  44.68 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0465  fatty acid desaturase  24.31 
 
 		 343 aa  50.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  21.94 
 
 		 372 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1834  fatty acid desaturase  25.41 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2414  fatty acid desaturase  26.43 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3139  fatty acid desaturase  26.34 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  23.53 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  24.8 
 
 		 361 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5527  hypothetical protein  25.23 
 
 		 293 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  24.8 
 
 		 361 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6151  fatty acid desaturase  23.55 
 
 		 315 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.767839  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  24.8 
 
 		 361 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  24.8 
 
 		 361 aa  47  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  24.8 
 
 		 361 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  24.8 
 
 		 361 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  24.8 
 
 		 361 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  24.8 
 
 		 361 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  24.58 
 
 		 360 aa  46.6  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06240  fatty acid desaturase, putative  23.68 
 
 		 429 aa  46.2  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  23.74 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  25.38 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1748  putative fatty acid desaturase  23.53 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  22.32 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  23.15 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0141  fatty acid desaturase  31.13 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6514  fatty acid desaturase  23.42 
 
 		 314 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1533  fatty acid desaturase  28.1 
 
 		 341 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000066309  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6657  fatty acid desaturase  25.2 
 
 		 360 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  24.07 
 
 		 387 aa  43.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  24.23 
 
 		 342 aa  43.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7410  Fatty acid desaturase  23.21 
 
 		 315 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918419  normal  0.292406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>