More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2441 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
215 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  100 
 
 
215 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
215 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  96.28 
 
 
232 aa  332  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  96.28 
 
 
215 aa  331  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  96.28 
 
 
214 aa  328  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  97.64 
 
 
214 aa  324  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  92.09 
 
 
261 aa  310  7.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  92.56 
 
 
215 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  92.56 
 
 
215 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  92.56 
 
 
215 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  92.56 
 
 
215 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  92.56 
 
 
215 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  92.56 
 
 
215 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  92.56 
 
 
316 aa  309  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  71.03 
 
 
217 aa  235  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  70.09 
 
 
217 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  70.56 
 
 
217 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  59.59 
 
 
212 aa  201  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  59.05 
 
 
294 aa  197  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  56.73 
 
 
209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  59.62 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  59.62 
 
 
209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  46.83 
 
 
216 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  46.83 
 
 
216 aa  145  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  41.09 
 
 
215 aa  143  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  48.77 
 
 
218 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  45.22 
 
 
217 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  48.17 
 
 
227 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  42.4 
 
 
219 aa  138  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  42.4 
 
 
219 aa  138  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  46.34 
 
 
217 aa  138  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 
222 aa  137  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  46.12 
 
 
220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  48.52 
 
 
227 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  43.04 
 
 
244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  41.94 
 
 
219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  41.94 
 
 
219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  41.94 
 
 
219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  41.94 
 
 
219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  41.94 
 
 
219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  41.94 
 
 
219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  42.66 
 
 
220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  42.66 
 
 
220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  42.66 
 
 
220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  42.66 
 
 
220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  42.66 
 
 
220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  41.47 
 
 
219 aa  128  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  41.78 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  41.45 
 
 
241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  55.65 
 
 
237 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  55.65 
 
 
237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  42.73 
 
 
220 aa  125  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  48.44 
 
 
235 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  50.76 
 
 
222 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 
231 aa  121  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  37.78 
 
 
218 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  51.91 
 
 
229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  38.97 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  49.24 
 
 
236 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  49.24 
 
 
247 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  49.24 
 
 
240 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  42.03 
 
 
225 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  51.15 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  43.06 
 
 
219 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  52.07 
 
 
221 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  43.48 
 
 
229 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  36.41 
 
 
205 aa  114  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  50.41 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  50.41 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  45.11 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  40.76 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  41.04 
 
 
230 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  51.22 
 
 
216 aa  112  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  41.04 
 
 
230 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  41.04 
 
 
230 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  41.04 
 
 
230 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  51.22 
 
 
217 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  39.35 
 
 
218 aa  112  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  45.04 
 
 
222 aa  111  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  45.32 
 
 
220 aa  111  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  36.84 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  37.1 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 
230 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  42.54 
 
 
374 aa  109  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  38.57 
 
 
214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 
230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 
230 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  37.17 
 
 
228 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  37.17 
 
 
228 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  39.05 
 
 
225 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  43.94 
 
 
230 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  42.68 
 
 
223 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  37.62 
 
 
217 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  36.73 
 
 
228 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  43.67 
 
 
228 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>