More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2426 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5749  Alpha/beta hydrolase  86.27 
 
 		 408 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1810  alpha/beta hydrolase fold  98.77 
 
 		 408 aa  795    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424856  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2426  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 408 aa  806    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278939 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2422  alpha/beta hydrolase fold  98.77 
 
 		 408 aa  795    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00445003  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1509  alpha/beta hydrolase fold  44.71 
 
 		 290 aa  226  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000127113 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3109  Ndr family protein  36.79 
 
 		 281 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112267  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4023  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 282 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2686  alpha/beta hydrolase fold protein  34.67 
 
 		 310 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.698481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2694  alpha/beta fold family hydrolase  27.54 
 
 		 290 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00231525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2171  alpha/beta hydrolase fold  23.18 
 
 		 312 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5789  alpha/beta hydrolase fold protein  31.66 
 
 		 306 aa  99.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.0718304 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0510  hypothetical protein  57.95 
 
 		 103 aa  97.1  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1996  alpha/beta hydrolase  44.54 
 
 		 138 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113138  normal  0.051716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1827  hydrolase  39.01 
 
 		 270 aa  90.1  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4090  alpha/beta hydrolase  45.87 
 
 		 121 aa  89.4  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5387  alpha/beta hydrolase  31.7 
 
 		 290 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5013  carboxylesterase Na  28.47 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  34.4 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5596  alpha/beta hydrolase  41.82 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3473  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2728  alpha/beta hydrolase  45.79 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0691218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  41.77 
 
 		 325 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1006  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3471  alpha/beta hydrolase  35.48 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2427  hypothetical protein  31.68 
 
 		 122 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0157231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4175  hypothetical protein  31.71 
 
 		 280 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516461  normal  0.259895 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2493  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000216292  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1791  hypothetical protein  34.34 
 
 		 121 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  33.61 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2781  hypothetical protein  32.32 
 
 		 122 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.692252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2732  hypothetical protein  32.32 
 
 		 122 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27725e-17 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  40.16 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0378  alpha/beta fold family hydrolase  25.11 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5547  alpha/beta hydrolase fold  28.75 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2533  hypothetical protein  32.32 
 
 		 122 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2719  hypothetical protein  32.32 
 
 		 122 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.584026  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2737  hypothetical protein  31.31 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  30.41 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0670  hypothetical protein  34.78 
 
 		 119 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17930  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.57 
 
 		 330 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.659857  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  25.22 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 282 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 		 226 aa  62.4  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  25.44 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 270 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  34.21 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  29.57 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  35.64 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  35.65 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  32.82 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.365456  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  25.73 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2565  hypothetical protein  29.29 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 		 277 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  36.73 
 
 		 292 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 		 312 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 		 291 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.86 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  27.38 
 
 		 263 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 		 291 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  37.61 
 
 		 256 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5567  hypothetical protein  33.67 
 
 		 119 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  41.41 
 
 		 281 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  37.61 
 
 		 256 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 		 291 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  37.61 
 
 		 256 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 267 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  26.34 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  33.63 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>