More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2355 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2332  ATPase  100 
 
 
286 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2355  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
286 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1720  ATPase  100 
 
 
286 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.501312  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5674  AAA ATPase  98.21 
 
 
280 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2371  ATPase  98.21 
 
 
280 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2251  ATPase  97.86 
 
 
280 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0945  ATPase  97.5 
 
 
280 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1331  ATPase, AAA family protein  92.28 
 
 
317 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00666024  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1016  ATPase, AAA family protein  92.86 
 
 
280 aa  517  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1936  ATPase, AAA family protein  91.93 
 
 
317 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1170  AAA family ATPase  93.21 
 
 
280 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0965  ATPase, AAA family protein  91.93 
 
 
335 aa  519  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0849  ATPase, AAA family protein  91.93 
 
 
317 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1444  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0299  ATPase, AAA family protein  92.86 
 
 
280 aa  517  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1178  AAA family ATPase  92.86 
 
 
280 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2101  ATPase  88.93 
 
 
280 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.316568 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0986  ATPase  81.98 
 
 
292 aa  484  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1023  AAA ATPase, central region:ATPase  81.27 
 
 
295 aa  478  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.58673  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3315  putative ATPase, AAA family protein  85 
 
 
280 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492501  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  85 
 
 
280 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.62341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0998  hypothetical protein  81.72 
 
 
290 aa  477  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451965  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1385  AAA ATPase central domain protein  80.5 
 
 
283 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0864  AAA ATPase central domain protein  80.57 
 
 
297 aa  474  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125814  normal  0.499704 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0929  AAA ATPase central domain protein  80.65 
 
 
293 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal  0.607082 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3556  ATPase central domain-containing protein  79.29 
 
 
280 aa  471  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.187416  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0906  ATPase  80.65 
 
 
289 aa  473  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.166593  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  78.93 
 
 
280 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0860  ATPase  77.86 
 
 
280 aa  461  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1094  ATPase, AAA family protein  78.52 
 
 
284 aa  461  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1661  ATPase  77.46 
 
 
284 aa  461  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3952  ATPase central domain-containing protein  77.11 
 
 
284 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2357  ATPase  77.11 
 
 
284 aa  459  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.797893  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4467  AAA ATPase central domain protein  76.06 
 
 
284 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179152  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0517  AAA ATPase, central region:ATPase  77.34 
 
 
301 aa  454  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3155  ATPase  76.06 
 
 
284 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1222  ATPase  76.76 
 
 
286 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02167  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  75.45 
 
 
278 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2516  ATPase  74.01 
 
 
278 aa  433  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.352302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1605  ATPase central domain-containing protein  73.29 
 
 
280 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.863754  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2653  AAA family ATPase  74.37 
 
 
279 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1191  ATPase  74.73 
 
 
279 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1589  AAA_5 ATPase  75.35 
 
 
284 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.566046  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1311  ATPase  74.37 
 
 
279 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4638  ATPase  71.79 
 
 
281 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.10339 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1409  ATPase  70.25 
 
 
281 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6213  ATPase  72.4 
 
 
281 aa  421  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32860  ATPase, AAA family protein  72.04 
 
 
281 aa  421  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29130  ATPase  71.12 
 
 
281 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0107931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3984  hypothetical protein  71.48 
 
 
281 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3873  ATPase  70.25 
 
 
281 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0352016  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4573  AAA family ATPase  69.53 
 
 
281 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0238067  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1580  AAA ATPase, central region:AAA ATPase, central region  69.53 
 
 
281 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.261649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1316  ATPase  69.53 
 
 
281 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436142  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4094  ATPase  69.89 
 
 
281 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.271648  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1788  ATPase  70.76 
 
 
281 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3905  ATPase, AAA family  68.82 
 
 
281 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.595065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5168  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  71.84 
 
 
283 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1883  putative clpA/clpB family protein  71.43 
 
 
280 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406023  normal  0.307774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1940  ATPase central domain-containing protein  70 
 
 
283 aa  411  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  72.22 
 
 
282 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0698667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1408  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  71.85 
 
 
282 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0894  ATPase  70 
 
 
279 aa  411  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3298  hypothetical protein  70.86 
 
 
281 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7091  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  70.97 
 
 
281 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158669  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4631  ATPase central domain-containing protein  71.84 
 
 
283 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1639  ATPase  70.04 
 
 
281 aa  410  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.435495  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5094  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  71.48 
 
 
283 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2058  ATPase  68.71 
 
 
277 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6260  ATPase  74.01 
 
 
280 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3462  ATPase  73.65 
 
 
280 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0889695  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0548  ATPase  69.29 
 
 
279 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4138  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  73.65 
 
 
280 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18588  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2682  AAA_5 ATPase  70 
 
 
285 aa  401  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0320361  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2541  ATPase  71.79 
 
 
281 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104036  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1719  ATPase central domain-containing protein  66.9 
 
 
290 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631647  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1910  ATPase  73.29 
 
 
280 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102293  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2894  ATPase  72.4 
 
 
289 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220244  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2638  ATPase  73.29 
 
 
281 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858309  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2122  ATPase  72.56 
 
 
280 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787616  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0809  ATPase  68.21 
 
 
284 aa  395  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652104  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2090  ATPase AAA_5  70.4 
 
 
281 aa  393  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0794647  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0802  AAA family ATPase  66.55 
 
 
284 aa  390  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4254  ATPase protein  67.97 
 
 
288 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1977  ATPase  69.68 
 
 
294 aa  386  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2134  ATPase  58.52 
 
 
291 aa  318  5e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00244059  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5020  AAA ATPase central domain protein  57.89 
 
 
278 aa  309  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.422648  normal  0.019419 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3608  AAA ATPase central domain protein  55.2 
 
 
289 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0108  ATPase  57.41 
 
 
292 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0213616  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2236  ATPase central domain-containing protein  48.54 
 
 
279 aa  259  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0437  MoxR-like ATPases  46.67 
 
 
280 aa  246  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.405282  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0047  ATPase central domain-containing protein  45.88 
 
 
281 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0936  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  87.3 
 
 
154 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2767  ATPase  45.07 
 
 
311 aa  219  5e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.313404  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1615  ATPase  43.91 
 
 
308 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830139  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1430  ATPase  42.81 
 
 
345 aa  207  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3717  ATPase-like protein  46.12 
 
 
331 aa  202  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2505  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.07 
 
 
315 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.543373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2067  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.62 
 
 
318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  37.75 
 
 
294 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3104  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.46 
 
 
343 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>