More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2313 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  99.69 
 
 
324 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
324 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  99.69 
 
 
324 aa  655    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  95.68 
 
 
324 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  95.06 
 
 
324 aa  626  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  96.3 
 
 
324 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  96.3 
 
 
324 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  85.8 
 
 
324 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  84.57 
 
 
324 aa  567  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  84.57 
 
 
324 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  84.57 
 
 
324 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  84.57 
 
 
324 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  84.57 
 
 
324 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  84.57 
 
 
324 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  84.57 
 
 
324 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  81.79 
 
 
324 aa  549  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  81.48 
 
 
324 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  80.86 
 
 
324 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  69.97 
 
 
325 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  68.21 
 
 
324 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.01 
 
 
326 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  68.01 
 
 
326 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  66.67 
 
 
327 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  67.28 
 
 
324 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  62.35 
 
 
323 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  62.73 
 
 
322 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  62.15 
 
 
325 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.62 
 
 
328 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  63.04 
 
 
322 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  63.04 
 
 
322 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  61.3 
 
 
324 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3099  putative quinone oxidoreductase  57.28 
 
 
327 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  59.75 
 
 
327 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2042  quinone oxidoreductase  57.28 
 
 
327 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.282793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2332  quinone oxidoreductase  57.28 
 
 
327 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1439  quinone oxidoreductase  57.28 
 
 
327 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1065  quinone oxidoreductase  57.28 
 
 
327 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1350  quinone oxidoreductase  57.28 
 
 
327 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  60 
 
 
324 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  59.88 
 
 
325 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.33 
 
 
324 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  56.97 
 
 
327 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  57.23 
 
 
330 aa  378  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  57.23 
 
 
344 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.02 
 
 
323 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  57.28 
 
 
331 aa  374  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  57.54 
 
 
327 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.82 
 
 
331 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.15 
 
 
325 aa  374  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.54 
 
 
328 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.48 
 
 
323 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.54 
 
 
324 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  57.23 
 
 
328 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  57.49 
 
 
326 aa  364  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.04 
 
 
322 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  58.28 
 
 
325 aa  364  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  55.38 
 
 
331 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.08 
 
 
326 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  57.54 
 
 
324 aa  363  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4628  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  54.63 
 
 
412 aa  362  6e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  56.31 
 
 
325 aa  360  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  54.46 
 
 
326 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.66 
 
 
326 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1604  alcohol dehydrogenase  53.85 
 
 
326 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.31 
 
 
324 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.04 
 
 
326 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  54.77 
 
 
325 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2478  alcohol dehydrogenase  61.61 
 
 
325 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00177585  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  54.77 
 
 
325 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.85 
 
 
326 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.66 
 
 
323 aa  353  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  54.46 
 
 
325 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  53.7 
 
 
324 aa  353  2e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00250  quinone oxidoreductase  54.77 
 
 
325 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  56.66 
 
 
323 aa  352  4e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.94 
 
 
324 aa  352  4e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2820  alcohol dehydrogenase  53.54 
 
 
326 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.516166 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.97 
 
 
331 aa  352  5e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.04 
 
 
323 aa  352  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  53.56 
 
 
329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2677  alcohol dehydrogenase  53.54 
 
 
326 aa  351  7e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  54.77 
 
 
325 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0021  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.77 
 
 
325 aa  351  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00189953  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2044  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.31 
 
 
324 aa  350  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  55.38 
 
 
325 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  56.62 
 
 
324 aa  348  5e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.78 
 
 
323 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4146  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  56.83 
 
 
315 aa  345  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2841  alcohol dehydrogenase  54.77 
 
 
324 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397829  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.31 
 
 
326 aa  345  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.38 
 
 
324 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2009  alcohol dehydrogenase  52.47 
 
 
323 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792874  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  51.69 
 
 
325 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2632  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.6 
 
 
324 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40031  decreased coverage  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1504  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.85 
 
 
324 aa  339  5e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1614  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.86 
 
 
260 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  54.21 
 
 
321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1596  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52 
 
 
326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3635  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  52.29 
 
 
328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5285  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  51.54 
 
 
326 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>