More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2194 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  90.24 
 
 		 410 aa  669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  790    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  96.83 
 
 		 410 aa  742    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  98.54 
 
 		 410 aa  782    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  98.54 
 
 		 410 aa  782    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  92.68 
 
 		 410 aa  692    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  91.95 
 
 		 410 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  62.38 
 
 		 405 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  63.73 
 
 		 405 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  60.57 
 
 		 480 aa  418  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  49.1 
 
 		 403 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  51.29 
 
 		 414 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  49.63 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  51.42 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  51.03 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  49.13 
 
 		 406 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  49.48 
 
 		 412 aa  363  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  48.15 
 
 		 413 aa  362  7.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  50.39 
 
 		 408 aa  362  8e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  48.58 
 
 		 405 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  48.58 
 
 		 405 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  47.07 
 
 		 410 aa  352  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  49.61 
 
 		 407 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  47.13 
 
 		 402 aa  348  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  49.87 
 
 		 430 aa  344  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  49.48 
 
 		 400 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  48.06 
 
 		 402 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  51.68 
 
 		 402 aa  338  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  50.39 
 
 		 408 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  47.8 
 
 		 402 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  48.95 
 
 		 400 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  46.35 
 
 		 405 aa  329  6e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  48.84 
 
 		 402 aa  328  7e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  50.26 
 
 		 408 aa  328  9e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  44.7 
 
 		 414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  48.43 
 
 		 406 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  41.6 
 
 		 404 aa  325  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  48.93 
 
 		 400 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  41.51 
 
 		 404 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  50 
 
 		 401 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  51.16 
 
 		 399 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  41.87 
 
 		 404 aa  322  9.000000000000001e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  48.24 
 
 		 528 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  46.5 
 
 		 416 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  46.21 
 
 		 416 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 410 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  48.87 
 
 		 409 aa  316  5e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  50.13 
 
 		 399 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  47.78 
 
 		 409 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  41.93 
 
 		 406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 412 aa  308  9e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  44.36 
 
 		 417 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  46.48 
 
 		 398 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  46.72 
 
 		 417 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  46.72 
 
 		 417 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  46.72 
 
 		 417 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  46.72 
 
 		 417 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  46.72 
 
 		 417 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  46.72 
 
 		 417 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  47.91 
 
 		 414 aa  296  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 411 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  41.1 
 
 		 413 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 411 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  40.81 
 
 		 411 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  39.15 
 
 		 421 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  39.65 
 
 		 433 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 412 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  38.9 
 
 		 412 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 405 aa  250  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 415 aa  245  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 412 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  36.52 
 
 		 414 aa  243  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  36.61 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  39.69 
 
 		 415 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  37.09 
 
 		 403 aa  223  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  41.73 
 
 		 421 aa  219  7e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  38.68 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 427 aa  208  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 389 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 411 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 422 aa  136  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 442 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 405 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 431 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 431 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 427 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 431 aa  123  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 430 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  27.4 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  27.64 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  27.48 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  26.81 
 
 		 452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  30.14 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>