More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2113 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 300 aa  607  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  99.67 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  99.67 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  97.33 
 
 		 301 aa  595  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  96 
 
 		 301 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  95.67 
 
 		 301 aa  587  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  95.67 
 
 		 301 aa  585  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  88.33 
 
 		 300 aa  549  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  88 
 
 		 300 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  88 
 
 		 300 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  88 
 
 		 300 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  88 
 
 		 300 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  88 
 
 		 300 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  88 
 
 		 300 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  88 
 
 		 300 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  82.49 
 
 		 320 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  83.72 
 
 		 302 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  82.15 
 
 		 308 aa  500  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  79.11 
 
 		 294 aa  477  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  78.77 
 
 		 294 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  77.66 
 
 		 319 aa  461  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  74.57 
 
 		 294 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  75.26 
 
 		 294 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  69.66 
 
 		 293 aa  421  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  67.91 
 
 		 297 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  66.55 
 
 		 323 aa  404  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  66.33 
 
 		 298 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  67.24 
 
 		 293 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  64.65 
 
 		 298 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  67.35 
 
 		 298 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  67.35 
 
 		 298 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  67.24 
 
 		 292 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  67.7 
 
 		 321 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  64.63 
 
 		 307 aa  394  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  65.07 
 
 		 296 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  64.95 
 
 		 296 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  63.45 
 
 		 290 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  62.94 
 
 		 296 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  63.79 
 
 		 292 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  64.01 
 
 		 292 aa  371  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  62.46 
 
 		 295 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  63.1 
 
 		 291 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  62.07 
 
 		 292 aa  367  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  62.41 
 
 		 292 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  63.1 
 
 		 292 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  62.8 
 
 		 295 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  62.46 
 
 		 295 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  62.41 
 
 		 292 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  62.63 
 
 		 290 aa  359  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  62.63 
 
 		 290 aa  359  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  60.92 
 
 		 287 aa  355  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  57.93 
 
 		 293 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1540  dihydrodipicolinate synthase  63.14 
 
 		 300 aa  352  5e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.336283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  62.76 
 
 		 292 aa  349  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  62.76 
 
 		 292 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  56.55 
 
 		 294 aa  337  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  58.76 
 
 		 292 aa  331  9e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  56.75 
 
 		 294 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  55.86 
 
 		 291 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  56.69 
 
 		 286 aa  324  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  52.16 
 
 		 302 aa  324  1e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  55.71 
 
 		 292 aa  318  5e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  54.86 
 
 		 292 aa  317  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  53.04 
 
 		 300 aa  316  4e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  53.61 
 
 		 301 aa  311  9e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  54.86 
 
 		 291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  54.86 
 
 		 291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0148  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 		 301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000206082  hitchhiker  0.0000319288 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1860  dihydrodipicolinate synthase  51.55 
 
 		 293 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 		 294 aa  299  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  52.92 
 
 		 294 aa  298  9e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  51.72 
 
 		 294 aa  297  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 294 aa  297  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 294 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2412  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 294 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0470285  hitchhiker  0.00564144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 294 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 294 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 294 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 294 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 289 aa  295  5e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 297 aa  295  9e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0678  dihydrodipicolinate synthase  56.54 
 
 		 300 aa  293  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 293 aa  293  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 		 292 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0492  dihydrodipicolinate synthase  51.56 
 
 		 298 aa  292  6e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  50.87 
 
 		 292 aa  291  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  50.87 
 
 		 292 aa  291  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  50.87 
 
 		 292 aa  291  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  50.87 
 
 		 292 aa  291  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 299 aa  291  8e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1908  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 293 aa  291  8e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 292 aa  290  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  50.87 
 
 		 292 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  51.03 
 
 		 291 aa  290  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  51.72 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 292 aa  289  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 292 aa  289  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 292 aa  289  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 292 aa  289  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>