More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1798 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1798  ABC transporter related  100 
 
 		 233 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6306  ABC transporter related  96.14 
 
 		 233 aa  420  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1773  ABC transporter related  96.14 
 
 		 233 aa  420  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057555  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5071  ABC transporter, ATPase subunit  91.42 
 
 		 233 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1684  ABC transporter related  89.7 
 
 		 233 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1712  ABC transporter related  89.27 
 
 		 266 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1498  ABC transporter related  87.12 
 
 		 233 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0282182 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2267  ABC transporter, ATP-binding protein  76.19 
 
 		 276 aa  317  9e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  76 
 
 		 231 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2320  ABC transporter, ATP-binding protein  77.42 
 
 		 276 aa  309  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1310  ABC transporter, ATP-binding protein  75.56 
 
 		 231 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0098  ABC transporter, ATP-binding protein  75.56 
 
 		 231 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2152  ABC transporter, ATP-binding protein  75.56 
 
 		 264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1797  ABC transporter, ATP-binding protein  75.56 
 
 		 231 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1068  ABC transporter, ATP-binding protein  75.56 
 
 		 231 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0987  ABC transporter related  70.14 
 
 		 246 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1864  ABC transporter related  69.12 
 
 		 242 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00206412  normal  0.0919522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2322  ABC transporter, ATPase subunit  67.74 
 
 		 242 aa  278  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0699  ABC transporter related  58.72 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0765  ABC transporter related  59.17 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0339667 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0749  ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 230 aa  234  7e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2540  ABC transporter-related protein  45.31 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263174  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1436  ABC transporter related  45.36 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal  0.0885291 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  33.18 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 220 aa  119  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0533  ABC transporter related  44.44 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  32.2 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1808  ABC transporter related  37.36 
 
 		 213 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0422599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.85 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  35.08 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.35 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  35.08 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3072  ABC transporter related  33.71 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.24 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1929  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  32.71 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0696107  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0129  ABC transporter related  36 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00335673  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.82 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.82 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  34.36 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  34.36 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.36 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.36 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0768  ABC transporter related  38 
 
 		 199 aa  101  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  36.56 
 
 		 362 aa  101  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.82 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.82 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  37.14 
 
 		 251 aa  101  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  34.36 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.36 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.36 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  34.36 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  31.46 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0168  ABC transporter, ATP-binding protein  34.23 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0382909  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.33 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  36.18 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  35 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  29.82 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  34.38 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1235  ABC transporter related  39.07 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  28.51 
 
 		 246 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  27.95 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 222 aa  99.4  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1116  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.02 
 
 		 249 aa  99.4  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.493823  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  36.2 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.848315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0700  ABC transporter related  34.13 
 
 		 241 aa  99  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.752157 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0433  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  32.88 
 
 		 242 aa  99  6e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.04 
 
 		 216 aa  98.2  9e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000852984  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  31.28 
 
 		 352 aa  98.2  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  34.5 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0701  ABC transporter related  38.89 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  36.7 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3967  ABC transporter related protein  34.23 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  34.27 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  32.27 
 
 		 350 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2670  ABC transporter related  26.67 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00350307  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  35.78 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2633  ABC transporter component  38.65 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1055  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  30.83 
 
 		 560 aa  93.6  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.573369 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5479  ABC transporter related  31.12 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  28.63 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  29.11 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0085  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  28.51 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1365  ABC transporter-related protein  32.37 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.886307  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0573  ABC transporter related protein  25.88 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.38 
 
 		 343 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  37.38 
 
 		 343 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  32.52 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.38 
 
 		 343 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3634  ABC transporter related  35.75 
 
 		 212 aa  93.6  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1503  phosphate transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 272 aa  92.8  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.529486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2606  ABC transporter related  30 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.0103017 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0184  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  34.18 
 
 		 278 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  30.48 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0599  ABC transporter related protein  28.89 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2240  ABC transporter related  38.42 
 
 		 206 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.748351  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  35.58 
 
 		 264 aa  92.4  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0020  ABC-type sugar transport system, ATPase component  29.49 
 
 		 373 aa  92.4  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3138  ABC transporter related  34.85 
 
 		 253 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0946  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  31.31 
 
 		 287 aa  92.4  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.754172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>