188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1684 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
239 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
239 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  96.65 
 
 
239 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  96.65 
 
 
239 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  97.07 
 
 
239 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  94.14 
 
 
239 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  94.14 
 
 
239 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  85.77 
 
 
243 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  85.77 
 
 
243 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  85.77 
 
 
243 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  84.85 
 
 
239 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  83.62 
 
 
239 aa  401  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  82.89 
 
 
239 aa  391  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  77.54 
 
 
239 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  74.01 
 
 
238 aa  351  5.9999999999999994e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  71.79 
 
 
238 aa  350  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  70.27 
 
 
245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.81 
 
 
240 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  70.67 
 
 
250 aa  324  8.000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.53 
 
 
247 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.83 
 
 
340 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  67.84 
 
 
244 aa  316  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  69.03 
 
 
246 aa  316  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.83 
 
 
242 aa  315  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  68.42 
 
 
246 aa  311  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  66.07 
 
 
232 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  65.62 
 
 
232 aa  309  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  66.07 
 
 
232 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  63.98 
 
 
255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  63.72 
 
 
239 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  64.07 
 
 
255 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.75 
 
 
340 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  67.53 
 
 
239 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  65.49 
 
 
254 aa  301  7.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  61.14 
 
 
244 aa  294  9e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  61.14 
 
 
244 aa  294  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.91 
 
 
236 aa  288  4e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  63.6 
 
 
274 aa  286  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.21 
 
 
244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  60 
 
 
439 aa  285  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.69 
 
 
268 aa  281  6.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.13 
 
 
240 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  61.8 
 
 
263 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  58.59 
 
 
242 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.95 
 
 
267 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.52 
 
 
267 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  55.36 
 
 
258 aa  268  8e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.07 
 
 
244 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.29 
 
 
255 aa  248  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  53.91 
 
 
255 aa  246  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.17 
 
 
243 aa  241  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  50.21 
 
 
344 aa  236  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  50.21 
 
 
269 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  50.21 
 
 
269 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  50.21 
 
 
269 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  50.21 
 
 
269 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  50.21 
 
 
269 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  50.21 
 
 
312 aa  234  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  49.79 
 
 
269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  49.56 
 
 
260 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.67 
 
 
260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.67 
 
 
260 aa  224  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.93 
 
 
246 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  46.93 
 
 
246 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
260 aa  222  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.23 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.23 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.23 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5538  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.29 
 
 
338 aa  211  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.13336 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  45.54 
 
 
245 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  47.81 
 
 
242 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0678  transcriptional regulator-related protein  44.78 
 
 
259 aa  202  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.48 
 
 
231 aa  194  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4415  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
251 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  41.96 
 
 
252 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.52 
 
 
248 aa  185  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  43.42 
 
 
234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2550  transcriptional regulator-related protein  40.09 
 
 
230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  41.96 
 
 
238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  42.48 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.18 
 
 
279 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1232  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.89 
 
 
257 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000235089 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
236 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
232 aa  174  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0044  hypothetical protein  39.01 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.01 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2890  hypothetical protein  39.01 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2195  hypothetical protein  39.01 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0643  hypothetical protein  39.01 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0657  hypothetical protein  39.01 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2512  hypothetical protein  39.01 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315481  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1537  hypothetical protein  39.32 
 
 
236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1356  hypothetical protein  39.82 
 
 
236 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.073199  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5994  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.03 
 
 
235 aa  171  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1803  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.18 
 
 
260 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2421  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
239 aa  168  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269594  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3302  cyclic nucleotide-binding protein  39.29 
 
 
260 aa  167  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896655  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4151  cyclic nucleotide-binding protein  39.29 
 
 
260 aa  167  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.066887  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4215  cyclic nucleotide-binding protein  39.29 
 
 
260 aa  167  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4390  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
262 aa  168  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>