19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1548 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1548  curculin domain-containing protein  100 
 
 
270 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  8.8677e-12  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1572  curculin domain-containing protein  100 
 
 
270 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  1.36518e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1092  curculin-like (mannose-binding) lectin  100 
 
 
270 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  1.12862e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1547  curculin domain-containing protein  47.88 
 
 
298 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  1.98605e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1091  curculin-like (mannose-binding) lectin  47.88 
 
 
298 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000304641  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1571  curculin domain-containing protein  47.88 
 
 
298 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00304753  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4524  curculin domain-containing protein  37.91 
 
 
226 aa  119  4e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.465524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  37.55 
 
 
374 aa  119  8e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  38.43 
 
 
788 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  34.38 
 
 
777 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  45.87 
 
 
190 aa  73.2  4e-12  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4136  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  42.11 
 
 
544 aa  67  3e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2757  hypothetical protein  28.8 
 
 
301 aa  64.7  2e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2913  outer membrane protein  28.8 
 
 
301 aa  64.7  2e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110077  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4552  putative curculin-like lectin  27.27 
 
 
852 aa  57.8  2e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.602066  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2237  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  30.09 
 
 
516 aa  55.8  6e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120186  hitchhiker  0.00817186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6642  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  31.9 
 
 
173 aa  52.4  7e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0494552 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0310  antifungal protein precursor, putative  31.47 
 
 
230 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.375674  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1026  hypothetical protein  33.62 
 
 
388 aa  42.7  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  decreased coverage  0.00589237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>