23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1547 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1547  curculin domain-containing protein  100 
 
 
298 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000198605  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1091  curculin-like (mannose-binding) lectin  99.66 
 
 
298 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000304641  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1571  curculin domain-containing protein  99.66 
 
 
298 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00304753  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1548  curculin domain-containing protein  47.88 
 
 
270 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000088677  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1092  curculin-like (mannose-binding) lectin  47.88 
 
 
270 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000112862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1572  curculin domain-containing protein  47.88 
 
 
270 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136518  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4524  curculin domain-containing protein  45.71 
 
 
226 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.465524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  43.12 
 
 
374 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  43.42 
 
 
788 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  43.89 
 
 
777 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  42.16 
 
 
190 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4136  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  44.74 
 
 
544 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0927  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  38.64 
 
 
511 aa  79.3  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6642  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  42.39 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0494552 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2237  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  32.54 
 
 
516 aa  72  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120186  hitchhiker  0.00817186 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4552  putative curculin-like lectin  30.09 
 
 
852 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.602066  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0010  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  40 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584311  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2757  hypothetical protein  29.15 
 
 
301 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2913  outer membrane protein  29.15 
 
 
301 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110077  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0310  antifungal protein precursor, putative  31.15 
 
 
230 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.375674  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1026  hypothetical protein  35.9 
 
 
388 aa  57  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  decreased coverage  0.00589237 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1140  lectin  30.19 
 
 
232 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0913  hypothetical protein  24.79 
 
 
174 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229802  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>