More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1527 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
328 aa  660    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  94.51 
 
 
328 aa  625  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  97.26 
 
 
328 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  97.26 
 
 
328 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1473  oxidoreductase domain-containing protein  91.16 
 
 
328 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  91.16 
 
 
328 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1681  oxidoreductase domain-containing protein  89.02 
 
 
328 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0855152 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1258  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  77.23 
 
 
327 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  77.23 
 
 
327 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1741  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  77.23 
 
 
327 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.994489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0151  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  77.23 
 
 
327 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1822  oxidoreductase, NAD-binding  77.23 
 
 
327 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1015  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  77.23 
 
 
327 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1806  oxidoreductase, NAD-binding  76.92 
 
 
327 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.677561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2514  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  77.85 
 
 
327 aa  454  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0152325  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  68.44 
 
 
348 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  68.12 
 
 
348 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  67.5 
 
 
334 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  34.65 
 
 
327 aa  172  9e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  37 
 
 
329 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  31.69 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  33.23 
 
 
354 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  35.14 
 
 
329 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  35.38 
 
 
334 aa  155  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  30.79 
 
 
329 aa  153  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 
331 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  31.6 
 
 
327 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  33.74 
 
 
329 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  32.3 
 
 
321 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  35.49 
 
 
332 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  36.36 
 
 
379 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  29.66 
 
 
324 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  33 
 
 
319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  29.66 
 
 
323 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 
321 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  34.46 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  32.73 
 
 
356 aa  136  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  34.77 
 
 
352 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  32.49 
 
 
362 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  32.82 
 
 
332 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  34.03 
 
 
345 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  33.62 
 
 
352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  34.64 
 
 
333 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  30.88 
 
 
667 aa  129  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  34.58 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  33.73 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  31.7 
 
 
349 aa  127  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  34.88 
 
 
338 aa  127  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26160  predicted dehydrogenase  34.15 
 
 
358 aa  126  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0688077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  34.91 
 
 
341 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  32.71 
 
 
334 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  32.92 
 
 
338 aa  123  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  35.06 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  28.44 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  30.9 
 
 
667 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  33.03 
 
 
357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  35.47 
 
 
354 aa  119  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  34.58 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  32.4 
 
 
447 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 
667 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  31.21 
 
 
346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  33.64 
 
 
338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1210  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  28.22 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  26.52 
 
 
329 aa  113  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  28.34 
 
 
451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  31.9 
 
 
665 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  32.01 
 
 
335 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 
356 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  26.32 
 
 
349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  29.54 
 
 
323 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  28.82 
 
 
667 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  33.97 
 
 
360 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.73 
 
 
327 aa  107  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  32.24 
 
 
338 aa  106  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.52 
 
 
338 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  32.13 
 
 
338 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  28.23 
 
 
388 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 
326 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  28.06 
 
 
343 aa  103  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.91 
 
 
349 aa  102  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  22.68 
 
 
370 aa  102  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.91 
 
 
349 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  26.01 
 
 
331 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1333  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 
665 aa  99.8  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  37.56 
 
 
344 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  27.64 
 
 
359 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  31.66 
 
 
670 aa  97.4  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  27.3 
 
 
366 aa  95.9  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05910  cytidyltransferase-related enzyme  27.74 
 
 
464 aa  94.4  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737737 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 
321 aa  90.9  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  31.84 
 
 
327 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  26.42 
 
 
361 aa  90.5  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  32.71 
 
 
328 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  25 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  30.07 
 
 
331 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  32.56 
 
 
326 aa  87  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
332 aa  86.3  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>