More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1329 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  67.24 
 
 
756 aa  954    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  67.24 
 
 
756 aa  954    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  67.81 
 
 
756 aa  961    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  67.66 
 
 
820 aa  960    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  92.67 
 
 
696 aa  1293    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  47.97 
 
 
705 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  67.24 
 
 
756 aa  954    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  68.23 
 
 
822 aa  977    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  96.76 
 
 
696 aa  1324    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
701 aa  1408    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  67.66 
 
 
756 aa  961    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  96.76 
 
 
696 aa  1324    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  48.22 
 
 
707 aa  638    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  67.24 
 
 
756 aa  954    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  47.93 
 
 
707 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  45.07 
 
 
704 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  45.32 
 
 
776 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  46.49 
 
 
755 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  44.88 
 
 
758 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  43.52 
 
 
689 aa  577  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  42.8 
 
 
708 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  42.09 
 
 
738 aa  550  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  46.63 
 
 
721 aa  548  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  44.89 
 
 
705 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  43.7 
 
 
708 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  42.47 
 
 
739 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  42.23 
 
 
718 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  41.83 
 
 
720 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  43.37 
 
 
728 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  43.35 
 
 
742 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  43.47 
 
 
770 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  43.41 
 
 
747 aa  528  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  42.14 
 
 
723 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  43.52 
 
 
747 aa  524  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  43.22 
 
 
747 aa  522  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  43.04 
 
 
746 aa  521  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  43.86 
 
 
727 aa  522  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  42.44 
 
 
690 aa  499  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  42.35 
 
 
703 aa  491  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  41.14 
 
 
712 aa  475  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  38.05 
 
 
720 aa  440  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  37.41 
 
 
703 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  33.97 
 
 
716 aa  349  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  32.35 
 
 
730 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  32.21 
 
 
730 aa  324  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  32.87 
 
 
717 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  32.24 
 
 
749 aa  320  5e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  32.54 
 
 
784 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 
728 aa  312  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  30.48 
 
 
710 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 
717 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  33.85 
 
 
724 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 
726 aa  284  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  31.3 
 
 
721 aa  270  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  29.23 
 
 
779 aa  257  5e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 
735 aa  256  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  30.64 
 
 
737 aa  239  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  28.27 
 
 
797 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  28.79 
 
 
813 aa  224  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 
399 aa  194  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.22 
 
 
601 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 
797 aa  170  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  29.44 
 
 
527 aa  165  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 
719 aa  163  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 
723 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.56 
 
 
833 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 
850 aa  160  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 
829 aa  160  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 
707 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.75 
 
 
718 aa  159  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 
770 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 
789 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 
701 aa  158  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 
710 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 
831 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  25.96 
 
 
713 aa  156  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 
733 aa  155  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 
701 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  24.2 
 
 
711 aa  154  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 
701 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 
710 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  24.33 
 
 
700 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  27.39 
 
 
747 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.14 
 
 
706 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 
859 aa  151  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 
749 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  26.65 
 
 
747 aa  150  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 
701 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  26.21 
 
 
745 aa  150  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  27.25 
 
 
747 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  26.43 
 
 
747 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 
705 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  26.37 
 
 
747 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  26.4 
 
 
747 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 
806 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  24.74 
 
 
699 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  25.6 
 
 
729 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 
863 aa  147  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 
705 aa  146  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  27.34 
 
 
778 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>