More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1298 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0802  acetyl-coenzyme A synthetase  78.93 
 
 		 555 aa  845    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1539  acetyl-CoA synthetase  78.74 
 
 		 541 aa  845    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1709  acetyl-coenzyme A synthetase  78.93 
 
 		 541 aa  846    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0554  acetyl-coenzyme A synthetase  78.93 
 
 		 541 aa  846    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4459  AMP-dependent synthetase and ligase  93.69 
 
 		 539 aa  1016    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2753  acetyl-coenzyme A synthetase  78.41 
 
 		 541 aa  840    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522899  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1298  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 539 aa  1083    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1395  putative acetyl-CoA synthetase  69.35 
 
 		 556 aa  733    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1992  AMP-dependent synthetase and ligase  90.72 
 
 		 539 aa  984    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  69.53 
 
 		 553 aa  728    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1317  acetyl-coenzyme A synthetase  78.93 
 
 		 541 aa  846    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  70.3 
 
 		 557 aa  747    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0835  AMP-dependent synthetase and ligase  96.29 
 
 		 539 aa  1038    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1509  acetyl-coenzyme A synthetase  78.74 
 
 		 555 aa  843    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.611762  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  92.58 
 
 		 539 aa  1009    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  96.29 
 
 		 539 aa  1038    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0599  acetyl-coenzyme A synthetase  78.93 
 
 		 541 aa  846    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197066  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  92.39 
 
 		 539 aa  1007    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3527  AMP-dependent synthetase and ligase  59.22 
 
 		 535 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.305269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  58.35 
 
 		 544 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6789  Acetyl-coenzyme A synthetase  55.12 
 
 		 535 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00873195  normal  0.0465133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  58.26 
 
 		 538 aa  581  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00574882  normal  0.320928 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  55.78 
 
 		 576 aa  581  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154325  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  55.49 
 
 		 535 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3985  AMP-(fatty) acid ligase protein  51.58 
 
 		 551 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  52.32 
 
 		 547 aa  549  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.519207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3543  AMP-dependent synthetase and ligase  52.69 
 
 		 543 aa  544  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  52.23 
 
 		 562 aa  533  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3834  AMP-dependent synthetase and ligase  51.76 
 
 		 543 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.077636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2096  AMP-dependent synthetase and ligase  52.69 
 
 		 532 aa  512  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4946  AMP-dependent synthetase and ligase  52.13 
 
 		 539 aa  495  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401789  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3285  AMP-dependent synthetase and ligase  51.53 
 
 		 513 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4434  AMP-dependent synthetase and ligase  52.7 
 
 		 562 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.51276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4898  AMP-dependent synthetase and ligase  52.32 
 
 		 562 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  45.34 
 
 		 571 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  44.4 
 
 		 595 aa  467  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0735  AMP-dependent synthetase and ligase  49.62 
 
 		 526 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  43.69 
 
 		 576 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1946  AMP-dependent synthetase and ligase  43.58 
 
 		 558 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2698  AMP-dependent synthetase and ligase  42.43 
 
 		 603 aa  438  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  41.89 
 
 		 562 aa  393  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  38.76 
 
 		 552 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 552 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0860  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 		 541 aa  352  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  40.22 
 
 		 522 aa  348  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  37.29 
 
 		 560 aa  332  7.000000000000001e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 		 571 aa  332  9e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 		 552 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  35.66 
 
 		 586 aa  326  5e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  39.14 
 
 		 525 aa  326  8.000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  36.84 
 
 		 537 aa  322  9.000000000000001e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 		 555 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 		 609 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 		 566 aa  320  5e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 		 616 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 567 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  36.85 
 
 		 530 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 		 555 aa  306  8.000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1839  AMP-dependent synthetase and ligase  38.97 
 
 		 548 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331932  normal  0.165167 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  39.24 
 
 		 588 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2213  AMP-dependent synthetase and ligase  38.02 
 
 		 561 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3525  AMP-dependent synthetase and ligase  37.64 
 
 		 549 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.244199 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  36.89 
 
 		 588 aa  300  6e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0450  acetyl-CoA synthetase, putative  37.52 
 
 		 556 aa  300  6e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.348474  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  36.89 
 
 		 588 aa  300  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31500  putative AMP-binding protein  39.46 
 
 		 555 aa  299  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555085  hitchhiker  0.0000351198 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1245  AMP-dependent synthetase and ligase  38.76 
 
 		 548 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267383  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2681  putative AMP-binding protein  39.27 
 
 		 555 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3983  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 		 557 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  35.47 
 
 		 592 aa  296  4e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  38.32 
 
 		 585 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  37.83 
 
 		 554 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267042  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5345  AMP-dependent synthetase and ligase  39.11 
 
 		 555 aa  294  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.526567  normal  0.149632 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  33.95 
 
 		 572 aa  293  5e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 530 aa  292  8e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6650  AMP-dependent synthetase and ligase  39.02 
 
 		 555 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187085  normal  0.039348 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 572 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  33.58 
 
 		 572 aa  291  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  36.75 
 
 		 602 aa  291  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 572 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 572 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 572 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 572 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 572 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3458  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 547 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0975472  normal  0.641138 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 		 555 aa  290  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 572 aa  289  9e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 572 aa  289  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 572 aa  289  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5971  AMP-dependent synthetase and ligase  38.75 
 
 		 557 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2545  AMP-dependent synthetase and ligase  37.03 
 
 		 563 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  36.02 
 
 		 549 aa  286  5e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6706  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 		 555 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  33.15 
 
 		 571 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  37.32 
 
 		 562 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 551 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  36.6 
 
 		 598 aa  283  8.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  32.9 
 
 		 571 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5727  AMP-dependent synthetase and ligase  38.37 
 
 		 557 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2909  AMP-dependent synthetase and ligase  38.15 
 
 		 563 aa  282  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.522952  normal  0.436285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>