37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1245 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1245  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  100 
 
 		 222 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0753275 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1273  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  95.95 
 
 		 222 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0792  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  95.95 
 
 		 222 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147641  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4416  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  89.64 
 
 		 232 aa  342  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2046  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  79.73 
 
 		 222 aa  331  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1163  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  86.49 
 
 		 222 aa  330  8e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.707422  normal  0.167545 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1151  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  86.49 
 
 		 222 aa  310  9e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3155  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  48.6 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0050  hypothetical protein  53.76 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.390549  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0028  hypothetical protein  52.13 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0029  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  51.06 
 
 		 219 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0520843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3188  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  44.95 
 
 		 245 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.605974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0171  hypothetical protein  50 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.846138 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6853  hypothetical protein  48.42 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1587  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  56.67 
 
 		 307 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1456  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  56.67 
 
 		 308 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0184396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1486  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  56.67 
 
 		 308 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3033  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  56 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623128  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0543  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  56 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39768  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2799  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  54.67 
 
 		 294 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0976082  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0610  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  56.34 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1260  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  56.34 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1077  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  42.01 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4290  hypothetical protein  44.91 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0075  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  38.5 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5370  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  36.32 
 
 		 229 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0548916  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0790  malonate decarboxylase  43.03 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00220342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4016  malonate decarboxylase  37.82 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1764  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  35.45 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1847  malonate decarboxylase  33.17 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.705884  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2496  hypothetical protein  27.48 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1142  putative malonate decarboxylase, subunit E  29.3 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0172841  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1327  hypothetical protein  28.33 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1062  hypothetical protein  31.88 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3293  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4946  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  31.4 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3870  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  31.4 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>