More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1191 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2085  diguanylate phosphodiesterase  89.27 
 
 
423 aa  690    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1101  diguanylate phosphodiesterase  90.73 
 
 
426 aa  707    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4326  diguanylate phosphodiesterase  92.72 
 
 
426 aa  798    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277437  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0737  diguanylate phosphodiesterase  98.36 
 
 
426 aa  842    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1191  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 
447 aa  897    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0738047  normal  0.284826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1101  diguanylate phosphodiesterase  91.22 
 
 
426 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1218  diguanylate phosphodiesterase  98.36 
 
 
426 aa  842    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.048247  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  61.74 
 
 
427 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  64.25 
 
 
403 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  64.07 
 
 
403 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  60.09 
 
 
427 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1744  diguanylate phosphodiesterase  55.16 
 
 
424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.943154  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1618  diguanylate phosphodiesterase  54.93 
 
 
446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991621  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2834  diguanylate phosphodiesterase  55.16 
 
 
440 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0677  EAL domain-containing protein  65.97 
 
 
482 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0823154  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1766  EAL domain-containing protein  65.97 
 
 
474 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561967  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1192  EAL domain-containing protein  65.97 
 
 
474 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.252573  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  39.45 
 
 
428 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  39.02 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2792  diguanylate phosphodiesterase  34.36 
 
 
427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  38.92 
 
 
428 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  39.26 
 
 
428 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  39.26 
 
 
428 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  39.26 
 
 
428 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0359  diguanylate phosphodiesterase  39.34 
 
 
423 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.834381  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  38.94 
 
 
428 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0565  EAL domain-containing protein  39.21 
 
 
515 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0400  cyclic diguanylate phosphodiesterase  39.21 
 
 
464 aa  240  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0380  cyclic diguanylate phosphodiesterase  39.21 
 
 
464 aa  240  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2288  diguanylate phosphodiesterase  35.19 
 
 
419 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000327147  normal  0.604082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0993  diguanylate phosphodiesterase  33.09 
 
 
441 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457608  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0415  diguanylate phosphodiesterase  38.3 
 
 
422 aa  233  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.404943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4292  diguanylate phosphodiesterase  36.96 
 
 
425 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  39.01 
 
 
424 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2214  diguanylate phosphodiesterase  38.5 
 
 
428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.706339  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0192  diguanylate phosphodiesterase  35.87 
 
 
429 aa  226  7e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2585  diguanylate phosphodiesterase  38 
 
 
424 aa  226  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0503461  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2455  diguanylate phosphodiesterase  38 
 
 
424 aa  226  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000463502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1925  diguanylate phosphodiesterase  38 
 
 
424 aa  223  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2537  diguanylate phosphodiesterase  38 
 
 
424 aa  223  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119746  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0778  diguanylate phosphodiesterase  37.97 
 
 
436 aa  222  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263766  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2561  diguanylate phosphodiesterase  38 
 
 
424 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0195477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3188  diguanylate phosphodiesterase  38.38 
 
 
436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.117578 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0758  diguanylate phosphodiesterase  37.5 
 
 
424 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5868  diguanylate phosphodiesterase  37.75 
 
 
424 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145256  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2662  EAL domain-containing protein  28.74 
 
 
428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1094  EAL domain-containing protein  34.92 
 
 
424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464012  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0943  cyclic diguanylate phosphodiesterase  34.92 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0939  EAL domain-containing protein  34.92 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876817  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2261  EAL domain-containing protein  34.67 
 
 
424 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807134  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0558  cyclic diguanylate phosphodiesterase  34.67 
 
 
422 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  34.67 
 
 
424 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2138  cyclic diguanylate phosphodiesterase  34.67 
 
 
422 aa  212  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0546  diguanylate phosphodiesterase  35.7 
 
 
424 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal  0.628054 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1176  diguanylate phosphodiesterase  33.59 
 
 
411 aa  193  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.82 
 
 
777 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.36212 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.5 
 
 
790 aa  187  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3887  diguanylate phosphodiesterase  29.43 
 
 
421 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0192627  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3700  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.25 
 
 
780 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.973532 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0770  diguanylate phosphodiesterase  28.15 
 
 
414 aa  166  8e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.294803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  26.46 
 
 
413 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2032  EAL domain protein  33.73 
 
 
396 aa  143  7e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  35.56 
 
 
416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05954  hypothetical protein  33.33 
 
 
272 aa  128  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000218  diguanylate phosphodiesterase  33.74 
 
 
272 aa  127  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.61 
 
 
584 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0220  hypothetical protein  30.94 
 
 
362 aa  123  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1754  diguanylate phosphodiesterase  35.98 
 
 
431 aa  123  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0220  hypothetical protein  30.94 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000198  EAL domain protein  31.09 
 
 
262 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000396049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.96 
 
 
596 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  35.63 
 
 
582 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  34.22 
 
 
592 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  36.21 
 
 
601 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0662  putative signaling protein  29.8 
 
 
266 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260634  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0470  hypothetical protein  33.2 
 
 
288 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129901  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.67 
 
 
605 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.4 
 
 
572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.69 
 
 
773 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  31.8 
 
 
357 aa  113  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  31.8 
 
 
379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.48 
 
 
883 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.88 
 
 
766 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.97 
 
 
599 aa  111  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.72 
 
 
580 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.32 
 
 
581 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  34.8 
 
 
590 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0612  diguanylate phosphodiesterase  33.14 
 
 
197 aa  110  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1598  GGDEF:CBS:EAL  34.67 
 
 
590 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0431902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1310  diguanylate phosphodiesterase  32.3 
 
 
306 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.016111  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.89 
 
 
590 aa  109  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0731  diguanylate phosphodiesterase  27.11 
 
 
263 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  29 
 
 
584 aa  107  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3003  diguanylate phosphodiesterase  27.18 
 
 
387 aa  107  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.88 
 
 
584 aa  107  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.15 
 
 
584 aa  106  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  32.75 
 
 
409 aa  106  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  30 
 
 
584 aa  106  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.15 
 
 
583 aa  106  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.51 
 
 
585 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>