More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0982 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
226 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  98.23 
 
 
226 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  98.23 
 
 
226 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  88.5 
 
 
226 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  88.5 
 
 
258 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  91.59 
 
 
226 aa  363  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  88.5 
 
 
226 aa  329  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  62.25 
 
 
226 aa  271  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  46.7 
 
 
240 aa  198  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  46.7 
 
 
238 aa  198  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  44.13 
 
 
249 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  49.02 
 
 
216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
227 aa  175  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  49.02 
 
 
216 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  45.37 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 
231 aa  161  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  42.31 
 
 
223 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
225 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 
228 aa  118  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1109  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
233 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
229 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 
245 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 
237 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
230 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
243 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 
233 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
244 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  35.57 
 
 
265 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2899  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
241 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527875  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 
250 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
230 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  35.08 
 
 
233 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
255 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
235 aa  102  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3761  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
247 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 
231 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  31.37 
 
 
247 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 
231 aa  98.6  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
215 aa  98.2  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
235 aa  98.2  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
232 aa  96.3  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  32.72 
 
 
233 aa  95.9  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
229 aa  95.9  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0496  transcriptional regulator, GntR family  35.67 
 
 
218 aa  95.5  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50739  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
229 aa  95.1  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
240 aa  94.7  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 
230 aa  94.7  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
264 aa  94.4  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
247 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.59 
 
 
223 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
260 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  30 
 
 
229 aa  92.8  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 
254 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1896  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 
204 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.280079  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
228 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
231 aa  92.4  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
235 aa  92.4  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 
239 aa  92  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 
224 aa  92  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
234 aa  92  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
223 aa  91.7  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 
225 aa  91.7  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2211  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153172  decreased coverage  0.00038585 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 
229 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 
237 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0035  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
224 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 
223 aa  89  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1712  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 
204 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
229 aa  88.6  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
231 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  33.33 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0106  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0518218  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
229 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>