More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0801 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  99.05 
 
 
316 aa  637  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  100 
 
 
316 aa  640  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  100 
 
 
316 aa  642  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  99.05 
 
 
316 aa  637  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  99.68 
 
 
316 aa  640  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  95.57 
 
 
316 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_004310  BR0513  ISBm3, transposase, programmed frameshift  51.26 
 
 
313 aa  314  1e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  50.16 
 
 
315 aa  304  1e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  50.16 
 
 
315 aa  304  1e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  50.16 
 
 
315 aa  304  1e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  50.16 
 
 
315 aa  304  1e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  50.16 
 
 
315 aa  304  1e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  50.16 
 
 
315 aa  304  1e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  50.16 
 
 
315 aa  304  1e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  50.16 
 
 
315 aa  304  1e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  50.16 
 
 
315 aa  304  1e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  49.84 
 
 
315 aa  303  3e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  49.84 
 
 
315 aa  303  3e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  49.84 
 
 
315 aa  303  3e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  49.84 
 
 
315 aa  303  3e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  49.84 
 
 
315 aa  303  3e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  49.84 
 
 
315 aa  303  3e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  49.84 
 
 
315 aa  303  3e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  49.84 
 
 
315 aa  303  3e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  50 
 
 
315 aa  302  5e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  50 
 
 
315 aa  302  5e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  47.78 
 
 
314 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  47.78 
 
 
314 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  47.78 
 
 
314 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  47.47 
 
 
314 aa  293  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  47.47 
 
 
314 aa  293  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  46.69 
 
 
315 aa  259  5e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0287  Integrase catalytic region  45.45 
 
 
318 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1036  Integrase catalytic region  45.45 
 
 
318 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1133  Integrase catalytic region  45.45 
 
 
318 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  41.43 
 
 
328 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  45.06 
 
 
318 aa  233  4e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  42.68 
 
 
328 aa  231  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  44.18 
 
 
481 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  42.68 
 
 
329 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  41.9 
 
 
358 aa  222  5e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  41.9 
 
 
358 aa  223  5e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  41.9 
 
 
358 aa  222  5e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  41.9 
 
 
358 aa  223  5e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  41.9 
 
 
358 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  42.24 
 
 
325 aa  220  2e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  41.49 
 
 
332 aa  213  3e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  41.49 
 
 
332 aa  213  3e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  41.41 
 
 
347 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  41.41 
 
 
330 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  2.89484e-05 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  41.1 
 
 
330 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  41.14 
 
 
330 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  41.14 
 
 
330 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  42.72 
 
 
309 aa  206  5e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  38.7 
 
 
329 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  38.7 
 
 
329 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  38.7 
 
 
329 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  38.02 
 
 
335 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  37.72 
 
 
335 aa  195  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  37.72 
 
 
335 aa  194  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2546  integrase catalytic subunit  38.68 
 
 
333 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  38.68 
 
 
333 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2591  integrase catalytic subunit  38.68 
 
 
333 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3937  integrase catalytic subunit  38.68 
 
 
333 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  38.36 
 
 
321 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3720  integrase catalytic subunit  38.36 
 
 
333 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158828  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  45.26 
 
 
422 aa  186  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0489  transposase  50 
 
 
195 aa  182  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1534  integrase catalytic subunit  38.19 
 
 
341 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1511  integrase catalytic subunit  38.19 
 
 
341 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  36.59 
 
 
320 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3273  Integrase catalytic region  35.71 
 
 
335 aa  172  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0797  Integrase catalytic region  35.14 
 
 
335 aa  172  7e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1610  Integrase catalytic region  35.74 
 
 
335 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11870  transposase  35.67 
 
 
365 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1334  Integrase catalytic region  35.14 
 
 
335 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.661987  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3283  Integrase catalytic region  34.04 
 
 
351 aa  166  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3687  Integrase catalytic region  34.04 
 
 
351 aa  166  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23770  integrase family protein  33.84 
 
 
334 aa  143  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5614  putative transposase  47.1 
 
 
208 aa  114  2e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2520  integrase catalytic region  31.16 
 
 
320 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  32.7 
 
 
338 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5595  integrase catalytic region  31.16 
 
 
320 aa  111  1e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3364  integrase catalytic region  31.16 
 
 
320 aa  111  1e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0490  transposase  53.4 
 
 
99 aa  110  2e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  30.56 
 
 
323 aa  109  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  30.25 
 
 
381 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  30.25 
 
 
381 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  30.25 
 
 
381 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  30.25 
 
 
381 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  30.25 
 
 
381 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0520  putative transposase  26.73 
 
 
327 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.693676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  30.25 
 
 
381 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0341  putative transposase  26.73 
 
 
327 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  30.25 
 
 
381 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  30.25 
 
 
323 aa  106  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  29.6 
 
 
323 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  31.65 
 
 
597 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  30.89 
 
 
379 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  30.89 
 
 
379 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.234878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>