More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0681 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  99.46 
 
 
186 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  100 
 
 
186 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  99.46 
 
 
186 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  91.4 
 
 
186 aa  342  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  90.86 
 
 
186 aa  340  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  90.86 
 
 
186 aa  338  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  85.48 
 
 
186 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  78.16 
 
 
186 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  77.59 
 
 
186 aa  279  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  72.13 
 
 
184 aa  268  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  71.98 
 
 
184 aa  266  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  68.93 
 
 
189 aa  263  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  74.71 
 
 
206 aa  258  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  82.76 
 
 
187 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  82.76 
 
 
187 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  82.76 
 
 
187 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  82.76 
 
 
187 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  82.76 
 
 
187 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  82.76 
 
 
187 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  82.76 
 
 
187 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  82.46 
 
 
187 aa  250  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  64.37 
 
 
183 aa  207  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  55.75 
 
 
195 aa  192  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  54.86 
 
 
193 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  52.49 
 
 
185 aa  188  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  55.43 
 
 
193 aa  187  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  51.34 
 
 
188 aa  184  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  51.35 
 
 
189 aa  182  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  52.57 
 
 
197 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2955  cytochrome B561  56.91 
 
 
188 aa  174  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593019  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  49.71 
 
 
178 aa  169  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  48.86 
 
 
197 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  49.73 
 
 
186 aa  165  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  47.37 
 
 
182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  49.12 
 
 
174 aa  155  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  45.7 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  43.81 
 
 
222 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  50 
 
 
188 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  48.24 
 
 
172 aa  138  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  39.2 
 
 
188 aa  135  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  50.88 
 
 
181 aa  132  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  41.82 
 
 
191 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  43.1 
 
 
184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  43.18 
 
 
188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  40.74 
 
 
203 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  40.76 
 
 
203 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  43.5 
 
 
209 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  43.2 
 
 
210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  46.67 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  38.76 
 
 
182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  36.17 
 
 
187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  42.93 
 
 
441 aa  114  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  41.21 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  41.81 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  37.29 
 
 
175 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  38.51 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  38.29 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  37.57 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  40.88 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  38.29 
 
 
187 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  33.33 
 
 
173 aa  109  3e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  38.6 
 
 
176 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  38.51 
 
 
180 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  35.84 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  38.17 
 
 
191 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  38.95 
 
 
177 aa  107  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  36 
 
 
175 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  34.71 
 
 
180 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  36.9 
 
 
190 aa  105  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  35.6 
 
 
204 aa  104  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  35.84 
 
 
191 aa  104  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  36.42 
 
 
181 aa  104  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  35.26 
 
 
183 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  37.78 
 
 
196 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  35.26 
 
 
183 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  34.1 
 
 
183 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  33.33 
 
 
192 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  36.47 
 
 
176 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  34.44 
 
 
183 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  38.24 
 
 
183 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  41.01 
 
 
197 aa  101  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  32.57 
 
 
182 aa  101  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  35.29 
 
 
176 aa  101  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  34.62 
 
 
176 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  37.79 
 
 
185 aa  101  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  34.62 
 
 
176 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  34.62 
 
 
191 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  38.95 
 
 
179 aa  100  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  32.57 
 
 
182 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  34.07 
 
 
176 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  34.1 
 
 
186 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  33.14 
 
 
183 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  36 
 
 
182 aa  99  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  33.53 
 
 
183 aa  98.6  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  37.8 
 
 
174 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  37.8 
 
 
175 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  36.81 
 
 
175 aa  98.6  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  34.62 
 
 
177 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  38.33 
 
 
421 aa  98.6  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  37.42 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>